重点实验室最新文章解析miRNA新家族

【字体: 时间:2007年04月11日 来源:生物通

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  来自中国科学院昆明动物所细胞与分子进化重点实验室(Key Laboratory of Cellular and Molecular Evolution),昆明灵长类研究中心(Kunming Primate Research Center)等处的研究人员通过对灵长类代表物种的研究,发现了一个快速进化的microRNA家族,这为研究蛋白编码基因的进化模式及其在功能进化中的作用提供崭新的视角。这一研究成果公布在《Genome Research》杂志(影响因子10.139)上。

  

生物通报道:来自中国科学院昆明动物所细胞与分子进化重点实验室(Key Laboratory of Cellular and Molecular Evolution),昆明灵长类研究中心(Kunming Primate Research Center)等处的研究人员通过对灵长类代表物种的研究,发现了一个快速进化的microRNA家族,这为研究蛋白编码基因的进化模式及其在功能进化中的作用提供崭新的视角。这一研究成果公布在《Genome Research》杂志(影响因子10.139)上。

领导这一研究是来自中科院昆明动物所宿兵博士,其早年毕业于武汉大学,之后于美国德克萨斯大学修斯顿人类遗传学中心进行博士后研究工作,目前任中国科学院昆明动物所研究员,细胞与分子进化重点实验室主任。

原文摘要:
Genome Research, DOI: 10.1101/gr.6146507
Published online before print April 6, 2007
Rapid evolution of an X-linked microRNA cluster in primates [Abstract]

miRNAs是一种21-25nt长的单链小分子RNA,对于它的研究起始于时序调控小RNA(stRNAs),由于miRNAs在物种进化中相当保守,在植物、动物和真菌中发现的miRNAs只在特定的组织和发育阶段表达,而且这种特异性和时序性,决定了组织和细胞的功能特异性,表明miRNA在细胞生长和发育过程的调节过程中起多种作用,因此miRNA的研究受到了生物学家的广泛关注。

目前绝大多数已知的microRNA在序列上都很保守,表明其承担着重要的生物学功能。然而,基因组中也可能存在快速进化的microRNA, 并在新的表型和功能的产生中发挥作用。 

在这篇文章中,研究人员通过对灵长类代表物种的研究,发现了一个快速进化的microRNA家族。这个家族位于X染色体上,并在睾丸中优势表达。在灵长类的进化过程中,这个家族不断通过基因重复产生新的拷贝,且拷贝数在灵长类物种间存在差异。同时,这个家族的microRNA序列变异的速度明显高于基因组中已知microRNA基因的平均水平,从而导致一些物种特异的microRNA基因的产生。

以前的很多研究表明,在灵长类的进化中,与雄性生殖相关的蛋白编码基因由于受到很强的选择,进化速度很快。宿兵研究员实验室的研究结果证实,除蛋白编码基因以外,microRNA基因也会受到达尔文正选择的影响,发生快速的进化。这一研究结果将为我们更为全面地了解非蛋白编码基因的进化模式及其在功能进化中的作用提供崭新的视角。
(生物通:万纹)

附:
宿兵 

中国科学院知识创新工程学科带头人,中科院“****”引进人才,理学博士,研究员,博士生导师;细胞与分子进化重点实验室主任。从事灵长类比较基因组学及现代人类起源和迁徙的研究。已在《Science》、《Nature Reviews Genetics》、《PNAS》、《AmericanJournal of HumanGenetics》、《Human Molecular Genetics》和《MolecularBiology and Evolution》等国际核心刊物上发表论文40余篇

学习和研究经历: 

1985.9-1989.7:本科,武汉大学生物系细胞生物学专业。 

1991.9-1996.7: 博士,中国科学院昆明动物研究所(导师:施立明院士)。 

1994.8-1995.2: 访问学生,美国加州大学圣地亚哥分校生物系。 

1996.8-1997.8: 副研究员,中国科学院昆明动物研究所。 

1997.9-2000.2: 博士后,美国德克萨斯大学修斯顿人类遗传学中心。 

2000.3-2001.5: Research Fellow, 美国德克萨斯大学修斯顿人类遗传学中心。 

2001.5-2004.10:美国辛辛那提大学基因组信息中心(Center for Genome Information) 助理教授

2001.9-至今: 中国科学院昆明动物所研究员, ,复旦大学客座教授 

曾获奖励:

1996:中国科学院自然科学奖一等奖(第三完成人)项目名称:中国特有珍稀动物类群的细胞和分子进化。

1997:国家自然科学奖三等奖(第三完成人)项目名称:中国特有珍稀动物类群的细胞和分子进化。

2002: 云南省自然科学一等奖(第三完成人)滇金丝猴生物学研究

2003 :教育部科技进步一等将(第三完成人)东亚人群的起源和史前迁徙研究 正在主持的科研项目: 1.中国科学院**** (2001-2004) 

2.国家高技术研究发展计划(863计划)-云南具有疾病相关表型隔离人群遗传资源的收集和研究 (2002-2004) 

3.国家基金委面上项目-云南元谋新石器时代人群的古DNA及其源流研究 (2004-2006) 

4.云南省科委面上基金-Neuropsin基因的分子进化与灵长类认知起源的分子机制(2004-2006) 

5.中科院重要创新方向项目-基因组新结构和新功能发生的进化遗传学机制 (2004-2006) 


发表论文:(截止2005年2月) 

1.Yang S, Liu Y, Lin AA, Cavalli-Sforza LL, Zhao ZM, Su B. 2005 Adaptive evolution of MRGX2, a human sensory neuron specific gene involved in Nociception. Gene (in press)

2.Wang YQ, Qian YP, Yang S, Shi H, Liao CH, Zheng HK, Wang J, Lin AA, Cavalli-Sforza LL, Underhill PA,Chakraborty R, Jin L, Su B. 2005 Accelerated evolution of the PACAP precursor gene during human origin.Genetics. (in press)

3.Ma LY, Marmor M, Zhong P, Ewane L, Su B, Nyambi P. 2005 Distribution of CCR2-64I and SDF1- 3’A Alleles and HIV Status in 7 Ethnic Populations of Cameroon. J AIDS (in press).

4.Liu Z, Wang Y, Su B. 2005The mitochondrial genome organization of the rice frog, Fejervarya limnocharis (Amphibia: Anura): a new gene order in the vertebrate mtDNA. Gene (in press)

5.Xu HL, Su B. 2005 Genetic evidence of strong functional constraint of neurotrypsin during primate evolution. Cytogenetic and Genome Research. 108:303-309 

6.Wen B, Li H, Gao S, Mao X, Gao Y, Li F, Zhang F, He Y, Dong Y, Zhang ,Y, Huang W, Jin J, Xiao C, Lu D,Chakraborty R, Su B, Deka R, Jin L. 2004. Genetic structure of Hmong-Mien speaking populations in East Asia As revealed by mtDNA lineages. Mol. Biol. Evol. (published online on November 17, 2004)

7.Li Y, Qian YP, Yu XJ, Wang YQ, Dong DG, Sun W, Ma RM, Su B 2004 Recent origin of a hominoid specific splice form of neuropsin, a gene involved in learning and memory. Mol. Bio. Evol. 21:2111-2115.

8.Wen B, Li H, Lu D, Song X, Zhang F, LiF, Gao Y, Mao X, Zhang L, Qian J, Tan J, Jin J, Huang W, Deka R, Su B, Chakraborty R, Jin L. 2004 Genetic evidence supports demic diffusion of Han people. Nature 431:302-305.

9.Wang YQ, Su B. 2004 Molecular evolution of microcephalin, a gene determining human brain size. Human Molecular Genetics 13:1131-1137.

10.Qian, YP, Jin L, Su B. 2004 Construction and characterization of bacterial artificial chromosome library of black-handed spider monkey (Ateles geoffroyi)Genome47(2): 239-245. 

11.Xu HL., Qian YP., Nie WH., Chi JX., Yang FT., Su B. 2004Construction, characterization and chromosomal mapping of bacterial artificial chromosome (BAC) library of Yunnan snub-nosed monkey (Rhinopithecus bieti). Chromosome Research 12:251-262.

12.Ramana GV, Su B. et al. 2001 Y-chromosome SNP haplotypes suggest evidence of gene flow among caste, tribe, and the migrant Siddi populations of Andhra Pradesh, SouthIndia. Eur. J. Hum. Genet. 9:695-700.

13.Jin L and Su B. (评论)2001 The Y chromosome and the replacement hypothesis. Science 293:567-568. 

14.Ke YH, Su B. et al. 2001 No independent origin of modern humans in East Asia: a tale of 12,000 Y chromosomes. Science 292:1151-1153. 

15.Su, B et al. 2001 Genetic diversity and population history in Red Panda (Ailurus fulgens) as inferred from mitochondrial DNA sequence variations. Mol. Bio. Evol. 18:1070-1076.

16.Jin L and Su B. 2000 Natives or Immgrants: Modern human origin in East Asia. Nature Reviews Genetics 1:126-133. 

17.Su,B et al. 2000 Y chromosome haplotypes reveal prehistorical migrations to the Himalayas. Human Genetics 107:582-590.

18.Su, B et al.2000Distributions of three HIV-1 resistant polymorphisms (SDF1-3"A, CCR2-64I, and CCR5-D32) in Global Populations.European Journal of Human Genetics 8:939-945.

19.Su,B et al. 2000 Polynesian Origins: New Insights from the Y-chromosomeProceedings of NationalAcademy of Sciences (PNAS), USA 97:8225-8228. 

20.Qian YP, Qian BZ, Su B. 2000 Multiple Origins of Tibetan: Y Chromosome Evidences. Human Genetics 106:453-454. 


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