任兵博士新实验方案促转录研究

【字体: 时间:2007年02月08日 来源:生物通

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  加州大学路德维格癌症研究所华裔研究人员任兵(Bing Ren,通讯作者)等人在人类基因组中发现了一个功能性元件。这项研究的论文发表在近期的《自然·遗传学》杂志上。

  

生物通报道:加州大学路德维格癌症研究所华裔研究人员任兵(Bing Ren,通讯作者)等人在人类基因组中发现了一个功能性元件。这项研究的论文发表在近期的《自然·遗传学》杂志上。

该研究小组成员开发了一套新的方案,可以用它来识别和预测调控基因转录的核苷酸区域,包括“启动子”和“增强子”。

研究人员介绍说,人类基因组是包裹在染色质当中的,确切地说是由组蛋白包裹DNA。在全基因组序列的基础上,研究人员对人类细胞的染色质结构进行了深入分析。

他们发现,一些已知启动子、增强子附近的经修饰的组蛋白都有一些独特的记号。根据这些特征,研究组采用一些计算机上的算法识别出了好几百个具有潜在调控功能的基因组区域。这种“组蛋白密码”可以准确地分辨启动子和增强子序列。

任兵是加州大学圣地亚哥分校细胞和分子医学系的副教授,他认为这种方法的理论具有普遍性,而且可以运用这套相对公正的方法探索基因表达在患病情况下是如何变化的分子机制。他介绍说,这个方法的魅力就在于它依赖组蛋白的化学特征,而不是DNA的。现在常用来预测增强子的方法完全依赖于DNA序列,这种方法是不可靠的。

对于组蛋白修饰特征的解析将让科学家快速识别出基因的增强子和启动子,在此基础上可以进一步方便快捷地识别调控基因表达的因子。这种方法还可以用来识别在癌症发生过程中基因网络异常的发生,这将推动癌症检测技术的开发。(生物通雪花)

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