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来自然科学基金委员会的消息,以南开大学席真教授为负责人、由李正名院士、曹淑桂教授和杨光富教授组成的项目组,在国家自然科学基金重点项目的资助下,两年来围绕着“生物合理设计绿色农药的分子基础研究”进行了系统深入的研究,取得了突出的创新性成果。
生物通综合:来自然科学基金委员会的消息,以南开大学席真教授为负责人、由李正名院士、曹淑桂教授和杨光富教授组成的项目组,在国家自然科学基金重点项目的资助下,两年来围绕着“生物合理设计绿色农药的分子基础研究”进行了系统深入的研究,取得了突出的创新性成果。
主要成果介绍:
1.在农药靶酶的生物学研究及农药抗性的分子机制研究方面,建立了多种农药靶标如AHAS和ACCase等的蛋白表达体系并对这些靶标蛋白开展了酶学性质研究,较为系统地开展了乙酰乳酸合成酶的商品化除草剂抗性评价。首次发现了娃儿藤碱B的抗病毒机制主要是阻碍了烟草花叶病毒的颗粒组装。
2.在农药活性分子与靶酶的相互作用研究方面,获得了单取代磺酰脲类除草剂92825与拟南芥AHAS酶的复合物晶体,并结合3D-QSAR技术提出了单取代磺酰脲类除草剂与AHAS酶的相互作用模型。测定了单嘧磺酯钠盐的晶体结构,建立了单取代磺酰脲类除草剂水解速率与结构的定量关系,筛选出高活性化合物NK#05828。
3.在农药分子设计的QSAR理论研究方面,进一步发展了DFT/QSAR方法,建立了一种描述立体效应的一般化DFT参数,并将DFT/QSAR方法拓展到活性分子如嘧啶水杨酸类除草剂的药效构象分析。此外,通过分子模拟技术发现了芳氧苯氧羧酸以及环己二酮类除草剂与靶酶之间存在一个新的重叠结合位点(Ser-698)。
4.在农药活性化合物的设计与合成方面,合成了10类共计800多个新化合物,发现了多个高活性化合物,具有潜在的应用前景。
两年以来,发表论文42篇;申请中国发明专利14项(1项已授权)和PCT专利1项;获得中国发明协会发明创业奖、教育部高等学校自然科学奖一等奖和湖北省自然科学奖一等奖各1项;培养博士9名。
席真,南开大学化学生物学系主任、****特聘教授, 博士。男, 1983年,华中师范大学化学系本科毕业,1994年瑞典Uppsala 大学取得博士学位,1996-2001在美国哈佛医学院作博士后及研究员。长期从事生物有机化学及化学生物学研究十多年。近年来率先开展并成功地设计合成了对基因具有选择性调控作用的新概念先导化合物;设计、合成了具有对DNA bulge核酸结构选择性作用的有机小分子,开辟了小分子与核酸相互作用的新领域,拓展了经典核酸嵌入物的概念。参与发现并阐明了天然烯二炔类抗生素的化学作用机制和基因的损伤机制与分解机制,并将其发展为生物探针。分别在JACS、Biochemistry、CHEMISTRY & BIOLOGY、Organic Letters、Tetrahedron 和Bioorg.Med.Chem.等国际一流杂志上发表研究论文十几篇。与此同时,在小分子与核酸相互作用研究方面的权威性已得到国际同行的广泛认可,受邀发表研究综述三篇。
所参与的研究领域涵盖有机合成、生物化学、生物物理、分子药理学、分子毒理学、分子生物学、结构生物学、组合化学及生物芯片技术等许多领域,在完成许多有重要生物医学意义的科研成果的同时,也积累了协调多学科渗透、建立学科新领域的丰富经验。(生物通雪花)
研究方向:
基因损伤及其修复的化学生物学研究
农药的生物合理设计及化学生物学研究
代表性论文:
1. Z. Xi*, Y. J. Kwon*, L. S. Kappen, I. H. Goldberg, and X. L. Gao New Complex of Post-Activated Neocarzinostatin Chromophore with DNA: Bulge DNA Binding from the Minor Groove Biochemistry 2003, 42, 1186-1198
2. L. S. Kappen, Z. Xi, G. B. Jones, and I. H. Goldberg Stimulation of DNA Strand Slippage Synthesis by a Bulge Binding Synthetic Agent Biochemistry 2003, 42, 2166-2173.
3. Xi, Z.; Hwang, G.; Goldberg, I.H.; Harris, J.L.; Penningtong, W.T.; Fouad, F.S.; Qabaja, G.; Wright, J.M.; & Jones, G.B.; Targeting DNA bulged microenvironments with synthetic agents: Lessons from a natural product CHEMISTRY & BIOLOGY 2002,9,925-931.
4. Jiang, Z.; Hwang, G.;Xi,Z.; & Goldberg, I.H. Formation and Structure of a Novel Enediyne-RNA Base Covalent Adduct J. Am. Chem. Soc. 2002,124,3216-3217.
5. Kappen, L. S.;Xi, Z.;& Goldberg,I. H. Probing DNA single strands for single-base bulges with neocarzinostatin chromophore Biochemistry 2001,40, 15378-15383.
6. Xi, Z.; & Goldberg, I. H. Studies on Bulged DNA:Structure,Molecular Recognition And Damage In Advances in DNA Sequence-Specific Agents(G.B.Jones ed.)JAI Press,Greenwich,Vol 4,2001.
7. Gu, F.; Xi, Z.; & Goldberg, I. H. DNA Damage by Thiol-activated Neocarzinostatin Chromophore at Bulged Sites Biochemistry 2000, 39, 4881-4891.
8. Xi, Z., & I.H.Goldberg DNA-damaging Enediyne Compouds in Comprhensive Natural Products Chemistry ( Barton , D.H.R., Nakanishi,K., Eds.)Elsevier Science, Oxford, 1999, Vol. 7. 553-592.
9. Xi, Z., G.B.Jones, G.Qabaja, J.Wright, F.Johnson, &I.H.Goldberg Synthesis and DNA Binding of Spirocyclic Model Compouds Related to the Neocarzinostatin Chromophore Organic Letters 1999, 1 1375-1377
10. Xi, Z., Qun-Kai Mao, & I.H.Goldberg Mechanistic Studies on the Base-Catalyzed Transformation of Neocarzinostatin Chromophore: Roles of Bulged DNA Biochemistry 1999, 38 4342-4354.