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蛋白质组学在药物毒理上的应用
【字体: 大 中 小 】 时间:2007年02月13日 来源:生物通
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来自好莱坞2月9日的消息,以分子生物学技术为基础研究开发药物的全球最大生物技术公司Amgen(Applied Molecular Genetics,分子应用基因公司)的研究研究人员,利用液相色谱质谱联用仪 ( LC/MS/MS )技术,成功解析在进行施药之后的细胞代谢产物,这将对药物改良与毒理学范畴的研究有很大的贡献。
生物通报道:来自好莱坞2月9日的消息,以分子生物学技术为基础研究开发药物的全球最大生物技术公司Amgen(Applied Molecular Genetics,分子应用基因公司)的研究研究人员,利用液相色谱质谱联用仪 ( LC/MS/MS )技术,成功解析在进行施药之后的细胞代谢产物,这将对药物改良与毒理学范畴的研究有很大的贡献。
近年来,蛋白质组学蓬勃发展以来,其中质谱学是推动相关发现与鉴定的重要工具。根据不同性质的样本如血液样本、组织样本等,以及目标蛋白特性,可以采用不用的的分析方式。目前常用的两种方法为基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(Matrix assisted laser desorption/ ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)与液相色谱质谱联用仪(LC/MS/MS )两种。
研究人员S. Ma表示,“我们结合高效液相色谱(High performance liquid chromatography,HPLC)与质谱分析(mass spectrometry),精确的分析与鉴定出了代谢出的物质是什么”。这项研究对于细胞在施药之后的代谢反应做出实时的检测,不仅能确定疗效,也能针对毒性代谢物质的发现而对药物做直接的改良,是一项意义深远的发现。
(生物通:万纹)
附:
Amgen Inc [NasdaqNM: AMGN ]
成立于1980年,总部位于美国加州,最早名为AMGen(Applied Molecular Genetics),是以分子生物学技术为基础研究开发药物的公司。在1989年,其首个药物EPOGEN上市。目前为全球最大的生物技术公司,在加拿大,欧洲,澳洲和亚洲都有分支机构。
共有员工1.43万。2004年总收入为105.5亿美元,来自美国国内的收入约80%。
目前市值约757亿美元。
财 务 年 2004 2003 2002 2001 2000 (U.S. dollars in millions except diluted EPS )
总 收 入 10,550 8,356 5,523 4,016 3,629
研发支出 2,028 1,655 1,117 865 845
研发/总收入 19.2% 19.8% 20.2% 21.5% 23.3%
净 收 入 2,363 2,259 -1,392 1,120 1,139
摊薄后每股盈利 1.81 1.69 -1.21 1.03 1.05
主要产品及年销售额 应 用 2004 2003 2002 (U.S. dollars in millions)
EPOGEN 红细胞生成素 2,601 2,435 2,261
Aranesp 贫血症 2,473 1,544 416
ENBREL 关节炎 1,900 1,300 362
Neulasta 嗜中性白血球减少症 1,740 1,255 464
NEUPOGEN G-CSF 1,175 1,267 1,380
MALDI-TOF-MS简介
1. 基本原理
基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)是近年来发展起来的一种新型的软电离生物质谱,其无论是在理论上还是在设计上都是十分简单和高效的。仪器主要由两部分组成:基质附助激光解吸电离离子源(MALDI)和飞行时间质量分析器(TOF)。MALDI的原理是用激光照射样品与基质形成的共结晶薄膜,基质从激光中吸收能量传递给生物分子,而电离过程中将质子转移到生物分子或从生物分子得到质子,而使生物分子电离的过程。因此它是一种软电离技术,适用于混合物及生物大分子的测定。TOF的原理是离子在电场作用下加速飞过飞行管道,根据到达检测器的飞行时间不同而被检测即测定离子的质荷比(M/Z)与离子的飞行时间成正比 ,检测离子。MALDI-TOF-MS具有灵敏度高、准确度高及分辨率高等特点,为生命科学等领域提供了一种强有力的分析测试手段,并正扮演着越来越重要的作用。
有人这样预测:“这个世纪将是TOF和FT的世纪!”
2 分子量测定
分子量是有机化合物最基本的理化性质参数。分子量正确与否往往代表着所测定的有机化合物及生物大分子的结构正确与否。MALDI-TOF是一种软电离技术,不产生或产生较少的碎片离子。它可直接应用于混合物的分析,也可用来检测样品中是否含有杂质及杂质的分子量。分子量也是生物大分子如多肽、蛋白质等鉴定中首要的参数,也是基因工程产品报批的重要数据之一。MALDI-TOF的准确度高达0.1%~0.01%,远远高于目前常规应用的SDS电泳与高效凝胶色谱技术,目前可测定生物大分子的分子量高达600KDa。
3. 蛋白质组学中的质谱技术——肽质量指纹谱技术(PMF)
蛋白质组学是当前生命科学研究的前沿领域。对蛋白质快速、准确的鉴定是蛋白质组学研究中必不可少的关键性的一步。采用MALDI-TOF-MS测得肽质量指纹谱(PMF)在数据库中查询识别的方式鉴定蛋白质,是目前蛋白质组学研究中最普遍应用的最主要的鉴定方法。肽质量指纹谱(Peptide Mass Fingerprinting, PMF)是蛋白质被识别特异酶切位点的蛋白酶水解后得到的肽片段的质量图谱。由于每种蛋白的氨基酸序列(一级结构)都不同,当蛋白被水解后,产生的肽片段序列也各不相同,因此其肽质量指纹图也具有特征性。MALDI-TOF-MS分析肽混合物时,能耐受适量的缓冲剂、盐,而且各个肽片几乎都只产生单电荷离子,因此MALDI-TOF成为进行分析PMF的首选方法。在我们关于蛋白质组学研究的实际工作中,几乎所有的发现均是从这一部开始做起来的!利用该技术鉴定的一系列蛋白质已经发表在Oncogene、Clinical Cancer Research、Electrophoresis、Proteomics、中国科学 等一系列国内外学术期刊上。
4. 蛋白质组学中的质谱技术——肽序列标签技术(PST)
由于PMF鉴定结果的可靠性受诸多因素影响,使得部分鉴定结果往往不是十分明确,特异性不高。多肽氨基酸序列匹配被认为是特异性最好的鉴定方法。在蛋白质组学研究中,利用质谱测序一般采用两种方式:一种是利用串联质谱(MS/MS)测序;另一种是利用源后衰变(PSD)技术测序。
在反射式MALDI-TOF-MS中,当脉冲激光照射到微量样品与饱和小分子基质混合形成的共结晶上时,能量通过基质传递给样品,导致样品被解析电离,电离后形成的亚稳分子离子在飞经无场区(即飞行管区)时发生裂解(其活化能来自在离子源与基体发生的碰撞,在无场区与残留气体的碰撞,激光辐射及各种热机制等)所产生的子离子(即源后分解碎片离子),可以通过不断改变反射器电压来进行分离、收集并记录于检测器,形成能为多肽和蛋白质一级结构提供十分丰富而有效的结构信息的PSD质谱图。利用PSD谱图,结合数据库检索可以迅速、高特异性地鉴定蛋白质。
目前,在蛋白质组学研究中,部分经2DE分离的蛋白质样品无法通过PMF鉴定或鉴定结果不明确,可将PSD测序功能应用于这些蛋白质的鉴定。随着对PSD技术的不断研究和发展,尤其是结合MALDI-TOF-MS本身所具有的高灵敏度、高通量、样品靶点可多次应用测定、分析时主要产生单电荷准分子离子以及能够耐受一定量的盐和干扰物等特点,PSD-MALDI-TOF-MS将会在蛋白质组学、代谢组学以及药物筛选的研究中发挥更大的作用。
5. 寡核苷酸的分析
随着分子生物学技术和反义核酸药物技术的发展,越来越多的寡核苷酸片段被合成,用以作引物、探针以及反义药物等。对这些片段进行快速检测,以判断合成的是否完全及合成的序列是否正确,是完全必要的。包括MALDI-TOF-MS在内的生物质谱是迄今为止进行这种检测最好的手段。用MALDI-TOF-MS测定分析寡核苷酸,简单、快速、准确、灵敏。结合3’—外切酶和5’—外切酶可以对寡核苷酸全序列进行测定。