****博士最新《Genome Research》解析新模型

　　

生物通综合：来自中科院生物物理研究所，生物大分子实验室的研究人员建立了一个探索流感病毒演化的计算机新模型，即网络模型。他们的研究表明利用网络模型可以揭示流感演化及流行病学中的很多重要特征。这一研究成果于11月21日在线发表于Genome Research杂志。

文章的通讯作者是中科院****蒋太交博士，其早年毕业于中国科学院上海生物化学研究所，后在诺贝尔奖获得者，耶鲁大学Sidney Altman教授指导下从事人核糖核酸Ｐ的结构和功能研究。

了解流感病毒的演化规律对防治流感起着非常重要的意义。尽管流感基因组看似简单，但流感演化规律及其分子机制却难以捕捉。蒋太交研究组首次提出了利用网络模型来描述流感病毒全基因组共进化的信息，创造性地将每个病毒表示为一个基因组元件相关性网络。该研究工作还引进几个网络特性参数(连接度K、连接度变化R以及表征片断间协同进化程度的量C)，定量地描述出流感进化中的很多重要特征，如抗原演化及其结构基础、流感片断间的功能联系及片断间的重组等。该文章的评审专家一致认为这个新颍的网络模型是研究流感病毒全基因组演化的重要新方法，对系统了解流感演化分子机制至关重要，是该研究领域方法学上的重要进展。

原文摘要：
Published online before print November 21, 2007
Genome Research, DOI: 10.1101/gr.6969007
Networks of genomic co-occurrence capture characteristics of human influenza A (H3N2) evolution
『Abstract』

附：
蒋太交研究员

简历：
1999年: 中国科学院上海生物化学研究所， 获生物化学和分子生物学博士学位。

2002年：毕业于耶鲁大学计算机科学系，获计算机科学硕士学位。

1999-2002年：在诺贝尔奖获得者，耶鲁大学Sidney Altman教授指导下从事人核糖核酸Ｐ的结构和功能研究。

2003-2004年：在麻省理工学院Amy Keating教授实验室进行生物信息学与计算结构生物学研究。

2005年至今：任生物物理研究所研究员，中国科学院“****”获得者。

研究组工作摘要:
研究方向：研究细胞周期复杂的动态网络和网络设计来调控细胞周期。具体的研究内容包括以下几个方面：

a. 以酵母为模式生物，利用和发展高通量的实验方法大规模地研究与细胞周期相关的各种相互作用网络；
b. 发展计算生物学新算法，通过大规模的数据处理与整合来构建与模拟细胞周期网络；
c. 在生物大分子结构域（domain）或模体(motif)水平分析细胞周期网络形成机制；
d. 通过基因合成生物学和蛋白质设计方法在多层次水平来改变和调控细胞周期。

代表性论文:
Taijiao Jiang, Amy E Keating. AVID: An integrative framework for discovering functional relationships among proteins. BMC Bioinformatics 6(136) (2005).
Andrew McDonnell, Taijiao Jiang, Amy Keating and Bonnie Berger. Paircoil2: Improved Prediction of Coiled Coils from Sequence. Bioinformatics. (2006)
Taijiao Jiang, Sidney Altman. A protein subunit of human RNase P, Rpp14, and its interacting partner, OIP2, have 3' >5' exoribonuclease activity. PROC NAT ACAD SCI USA 99 (8), 295-5300 (2002).
Taijiao Jiang, Sidney Altman. Protein-protein interactions with subunits of human nuclear RNase P. PROC NAT ACAD SCI USA 98 (3), 920-5 (2001).
Taijiao Jiang, Guerrier-Takada, Cecellia, Sidney Altman. Protein-RNA interactions in the subunits of human nuclear RNase P. RNA 7(7), 937-41 (2001).