MIT发现至今最复杂的蛋白质结

【字体: 时间:2006年09月22日 来源:生物通

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  麻省理工(MIT)的一个研究组在一个蛋白质中发现了到目前为止看到的最复杂的结(knot),并且他们相信这种结与蛋白质充当标记需要销毁的蛋白质的标记物的功能有关。

  

生物通报道:麻省理工(MIT)的一个研究组在一个蛋白质中发现了到目前为止看到的最复杂的结(knot),并且他们相信这种结与蛋白质充当标记需要销毁的蛋白质的标记物的功能有关。

在蛋白质中,这种三维结构对蛋白质的功能非常重要。这项研究的结果刊登在915日的Public Library of ScienceComputational Biology上。

结(knot)在蛋白质中很罕见,在所有蛋白质中出现的频率低于1%。MIT的研究人员利用一种之前从未用来分析蛋白质的计算机技术分析了32853种蛋白质。

研究人员发现具有这种结的所有蛋白质都是酶。大部分具有一种简单的三叶形纽结(trefoil knot),还有一些则具有四个交叉口,而最复杂的一种五叉口结则只在一种泛素水解酶中发现。

这种复杂的结可能对泛素水解酶具有某种保护作用。这种酶的功能是保护其他的蛋白不被破坏。当一个蛋白质需要被破坏时,它会被蛋白质的死亡标记——泛素蛋白所标记。一旦这种死亡标记被“贴上”,这些蛋白质就会被送到蛋白体中切割成碎片。但是,如果泛素水解酶干预并移除泛素,则这个蛋白质就会免于“屠刀”下。

泛素水解酶中发现的这种复杂结可能阻止它在工作时陷入到蛋白体中。研究人员推测具有这种复杂结的蛋白质很难被拖入到蛋白体中,并且这种结使蛋白质很难被拆开。(生物通记者雪花)
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