中科大复旦联合发表PNAS文章

【字体: 时间:2006年08月07日 来源:生物通

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生物通报道:来自中国科技大学生命科学学院,合肥微尺度物质科学国家实验室(Physical Sciences at Microscale),以及复旦生命科学学院的研究人员通过酿酒酵母Urm1(ubiquitin-related modifier-1)蛋白的NMR结构分析,对蛋白修饰的长久以来的进化之谜提出了新的观点,这一研究成果公布在7月24日美国国家科学院院刊PNAS杂志上。

主持这一研究的主要是中科大的施蕴渝院士和复旦生科院副院长钟杨教授。

蛋白修饰(Protein modifiers)是一个在许多不同的生物过程中普遍存在的过程,调控这些过程中目标蛋白的活性和功能。虽然真核生物中泛素(ubiquitin)和泛素类蛋白(ubiquitin-like protein,Ubls)修饰已经得到确认,但是相关的蛋白修饰在原核细胞中还没有被发现,因此这一进化过程依然是个谜团。

中科大,复旦生科院以及上海生物信息技术中心(Shanghai Center for Bioinformation Technology)的研究人员利用泛素相关修饰蛋白1(ubiquitin-related modifier-1,Urml)的NMR结构进行了泛素超家族的结构比较和系统学分析,结果表明Urml是一种独一无二的“molecular fossil”(分子化石)——也就是说这种蛋白有着整个超家族共同祖先最保守的结构和序列特征,并且在Urml和MoaD(molybdopterin synthase small subunit)逐渐相似的3D结构,疏水性和静电表面特征(electrostatic surface features)都说明这两种蛋白作用的相似性,另外Urml-Uba4和MoaD-MoeB之间的共同点也在真核生物ATP-dependent蛋白结构和ATP-dependent硫化共因子(ATP-dependent cofactor sulfuration)之间建立了进化关联。(生物通:张迪)

原文:

Published online before print July 24, 2006, 10.1073/pnas.0604876103 
PNAS | August 1, 2006 | vol. 103 | no. 31 | 11625-11630 
Solution structure of Urm1 and its implications for the origin of protein modifiers 
Junjie Xu, Jiahai Zhang, Li Wang, Jie Zhou, Hongda Huang, Jihui Wu, Yang Zhong,,¶, and Yunyu Shi,||
[Abstract]

附:
泛素是一个由76个氨基酸组成的高度保守的多肽链,因其广泛分布于各类细胞而得名。泛素共价地结合于底物蛋白质的赖氨酸残基,被泛素标记的蛋白质将被特异性地识别并迅速降解,泛素的这种标记作用是非底物特异性的,在蛋白质降解过程中泛素的枢纽作用越来越得到研究者的重视。细胞中的蛋白质处于不断地降解与更新的过程中,保持细胞正常的蛋白质代谢对于生命的正常功能至关重要。控制蛋白质降解的机制尚未阐明,现在已清楚细胞蛋白的降解是一个复杂的、被严密调控的过程,此过程在细胞疾病和健康状态、生存和死亡的一系列基本过程中(细胞凋亡、DNA修复等)扮演重要角色, 蛋白质降解异常与许多疾病(恶性肿瘤,神经退行性疾患等)的发生密切相关。基因的功能是通过蛋白质的表达实现的,而泛素在蛋白质降解中的作用机制如能被阐明将对解释多种疾病的发生机制和遗传信息的调控表达有重要意义。

 

施蕴渝院士简历

施蕴渝,女,教授,博士生导师,中国科学院院士。

        19657月毕业于中国科学技术大学生物物理系。19659月-19702月,卫生部中医研究院,实习研究员。19702月-中国科学技术大学生物系助教,讲师,副教授,教授。1979年-1981年意大利罗马大学物理化学系访问学者。19846月-19851月及19903月-9月,荷兰格罗宁根大学物理化学系合作研究。19941月法国巴黎南大学,C.N.R.S酶学及生化结构实验室合作研究。199511月及19963月-4月法国NANCY大学CNRS理论化学实验室合作研究。

    曾任中国科学技术大学生命科学学院首任院长,中国科学技术大学学术委员会副主任,中国科学技术大学学术委员会结构生物学实验室(中国科学院重点实验室)学术委员会主任,教育部高等学校生物科学与工程教学指导委员会主任委员,中国科学院生物学部常委。国家863项目、国家自然科学基金委项目负责人、973项目中的课题负责人以及中国科学院知识创新项目负责人。

 


姓名: 钟扬
出生年月: 1964年5月
职称: 教授
联系地址: 上海市邯郸路220号 复旦大学生命科学学院 立人生物楼236室
联系电话: 021-55664436, [FAX]021-65642468
E-mail地址: yangzhong@fudan.edu.cn

简历:
湖南新宁人,1964年5月出生。
1979年考入中国科学技术大学少年班学习,获该校无线电电子学工学学士;
日本国立综合研究大学院大学(The Graduate University for Advanced Studies)生物系统科学博士。
1984 - 1999年任中国科学院武汉植物研究所研究实习员、助理研究员、副研究员(1992)、研究员(1996)、副所长(1997);
1992-1998年曾在University of California-Berkeley和Michigan State University进行合作研究4年;
2002-2006年曾两次任日本文部科学省统计数理研究所外国人客员教授。
2000年起任复旦大学生命科学学院教授,植物学和生物信息学博士生导师;
现为复旦大学生命科学学院常务副院长,生物多样性与生态工程教育部重点实验室副主任,上海生物信息技术研究中心副主任;兼任北京大学理论生物学中心教授、西藏大学教授。

主要研究方向:
分子进化与系统发育,生物信息学
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