美国向公众开放1.5版本微生物基因组数据处理系统

　　

生物通报道：美国能源部联合基因组研究所（U. S Department of Energy Joint Genome Institute，DOE JGI）已经向公众开放了1.5版本的IMG（综合微生物基因组）数据处理系统。IMG 1.5目前包含741个基因组序列，其中细菌基因组435个、古细菌32个、真核基因组15个和259个细菌抗菌素。在这700多个基因组中，有602个以及完成测序、139个完成了基因组草图。

IMG 1.5包含由美国能源部联合基因组研究所完成的62个已完整测序和100个基因组草图。与之前公开数据相比，IMG1.5含有了38个（17个已完成测序，21个草图）新的由DOE JGI的基因组和21个新公布的微生物基因组。

在基因组学研究中，根据DNA序列信息确定基因的精确位置仍然是一个大的挑战。DOE JGI已经在着手构建从共工资源中精选出的微生物基因组基因模型。作为向这个目标前进的一步，IMG1.5现在已经包含了22个带有构建的基因模型和详细方法和标准资料的古生物基因组。一个独立的IMG Curated Archaeal Genomes专门数据库包含了这些含有它们对应的原始基因组的基因组信息（http://img.jgi.doe.gov/archaeal_qa/），并且能够通过比较每个curated基因模型和它的原始序列来分析基因模型的变化。（生物通杨遥）