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鉴定疾病基因的强大软件问世
【字体: 大 中 小 】 时间:2006年05月10日 来源:生物通
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生物通报道:基因是很多疾病发生的最根本原因。但是要想更近距离地鉴定和研究这种基因则是全世界生物技术研究人员面临的一个重要挑战。来自ESAT-SCD和佛兰德斯大学生物技术学院(VIB,Flanders Interuniversity Institute for Biotechnology)的研究人员研发出了一种叫做ENDEAVOUR的计算机程序,该程序能用于编辑和处理来自各种数据库的数据并确定出在一种疾病中起到关键作用的基因。
毫无疑问,ENDEAVOUR将会成为鉴定疾病基因的一个不可或缺的工具。在检测这种程序的过程中,研究人员成功地确定出了一种在DiGeorge综合症的发生中起到主要作用的一种基因。
对致病基因的深入了解对疾病的诊断和治疗具有重要意义。但是如何从数量巨大的基因中找到这些关键基因确实研究人员面临的巨大挑战。经过数年的努力,全球的研究人员积累了数量巨大的遗传信息成果,但是这些数据的分析确实相当复杂。现在,研究人员的目光不但放在产生新的信息上,而且越来越关注如何破译现有资料上。
为了解码这些遗传资料,研究人员开发出了这种计算机程序ENDEAVOUR。ENDEAVOUR集合了所有已知与疾病或生物过程相关的基因的信息,并将这些数据整合成一种数学模型。在这种模型的帮助下,研究人员分析了已知基因和功能未知基因之间的相似性。ENDEAVOUR分析能显示出这些基因与一种特定疾病的相关的可能性。
研究人员目前已经在实验室中对ENDEAVOUR进行了微调和检测。在主要的疾病(如阿尔茨海默症、白血病、结肠癌和帕金森症)基因检测中,ENDEAVOUR发现了潜在的相关疾病基因。此外,研究人员还用ENDEAVOUR寻找到了DiGeorge综合症的一个可能的致病基因YPEL1。为了证明这种数学模型预测方法的正确性,研究人员使用斑马鱼作为模型系统来重现这种疾病。结果表明,敲除YPEL1基因的斑马鱼出现了与DiGeorgy综合症类似的严重症状。