《科学》本期专题:蛋白研究的新技术(下)

【字体: 时间:2006年04月17日 来源:生物通

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生物通编者按:科学与技术的关系从来就是密不可分的,在生命科学领域有关生物过程的许多重要结论都来自于传统的体外生物化学实验,x射线蛋白结晶学(x-ray crystallography),以及核磁共振仪(nuclear magnetic resonance (NMR) spectroscopy)的数据分析。要想更进一步探讨生命的奥妙,当然需要更精准,更便捷的工具。近期许多研究人员都在寻找能定量的了解细胞内部动态大分子——主要指蛋白质分子的功能的工具,因此本期(4月14日)《科学》杂志特以此为专题具体介绍了相关内容。


    NMR技术以及延伸应用

虽然即使可以看到分子的活动情况,但是这并不说明我们就知道了蛋白是如何工作的,我们仍然需要了解蛋白是如何运动的,而这方面核磁共振NMR仍然发挥着重要作用。这个带给其发现者诺贝尔奖的物理现象是一种利用原子核在磁场中的能量变化来获得关于核信息的技术。50多年来,由核磁共振转化为探索物质微观结构和性质的高新技术已取得了惊人的进展。Anthony Mittermaier和Lewis E. Kay总结了目前NMR技术的新进展,包括获得应用于可见蛋白运动过程的详细数据。这些方法被德国法兰克福歌德大学生物分子磁共振中心(Centre for Biomolecular Magnetic Resonance,BMRZ)的研究人员运用到一种肽载体蛋白(peptidyl carrier protein,PCP)上。

Science 14 April 2006:
Vol. 312. no. 5771, pp. 224 - 228
New Tools Provide New Insights in NMR Studies of Protein Dynamics 
[Abstract]

Science 14 April 2006:
Vol. 312. no. 5771, pp. 273 - 276
Conformational Switches Modulate Protein Interactions in Peptide Antibiotic Synthetases
[Abstract]

更多内容:

  卡内基梅隆大学的科学家用现成的分子生物学工具可以使活体细胞通过基因结构来改变他们的核磁共振成像(MRI)对比度们,新的成像方法可以称之为平台技术,适应于多种组织类型,而且在与分子治疗相关的潜伏期研究中有广泛应用 详细内容> >

  来自耶鲁大学Arthur L. Horwich 和他的同事利用核磁共振对一种与GroEL或者单个环状同工物(single-ring analog, SR1)结合的底物蛋白人二氢叶酸还原酶(human dihydrofolate reductase, hDHFR)状态进行研究。详细内容> >

 美国布法罗的一位研究人员在2003年引起了一大轰动:他公布了一种能更快、更精确获得核磁共振信息以确定蛋白质原子结构的比较便宜的方法。详细内容> >

 

    生物信息学补充方法

在蛋白研究中无论是结构学方面,还是动力学方面都离不开生物信息学方法的帮助,英国曼彻斯特大学的研究人员将蛋白动力学,晶体学实验和计算机模拟结合起来证明了一种酶短期的热力学运动对于解释氢离子通道的作用,同样来自美国宾州州立大学的Stephen J. Benkovic和Sharon Hammes-Schiffer也提出了一个相关的观点。

Science 14 April 2006:
Vol. 312. no. 5771, pp. 237 - 241
Atomic Description of an Enzyme Reaction Dominated by Proton Tunneling 
[Abstract]

Science 14 April 2006:
Vol. 312. no. 5771, pp. 208 - 209
Enzyme Motions Inside and Out
[Abstract]

更多内容:

 利用一种新颖的生物信息学分析手段,来自密歇根大学医学院的研究人员发现大部分前列腺癌症患者都携带了一种特殊的基因融合现象。详细内容> >

 国际种原保存中心(The National Center for Genome Resources, NCGR)8月25日开放了一个综合系统软件平台。 详细内容> >

 南京大学-IBM生物信息学联合实验室29日在南京大学生命科学学院落户。详细内容> >

(生物通:张迪

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