难道臭氧也对基因芯片有影响？

　　

生物通报道：
您的实验室正在利用基因芯片进行实验研究吗？

实验室的消毒手段是否有利用紫外线杀菌消毒？

如果包括了以上这两项，请注意以下这一数据：

随着臭氧浓度的增加，Cy5信号逐渐下降，在30-60 ppb（ppb,十亿分之一）信号大概损失了40％，更加严重的是，在80-90 ppb水平下，Cy5信号损失了大概50％。

由于大部分实验室使用Cy5/Cy3比率来检测Oligo芯片或cDNA芯片的结果，因此如果臭氧降低其中一种染料的信号而不是两种，这样会对生物芯片结果产生人为的不利影响。而且如果是在一次实验中做完所有的芯片，这个问题不大——因为信号损失是一样的。但是如果在不同的时间进行同一个芯片实验，或者在不同臭氧水平下进行的话，这个问题就比较严重。除此之外，臭氧的形成过主要是由太阳紫外辐射来完成，而实验室中的消毒手段有很大一部分是利用紫外消毒，这样难免会增加臭氧浓度，因此影响也较大。

最近著名的斯坦福大学医学院Pat Brown芯片实验室联合SciGene公司发布了这个研究结果。研究测试了不同水平的臭氧对Cy5染料以及Cy5/Cy3比率的影响，结果发现空气中正常浓度水平的臭氧会破坏Cy5染料以及芯片研究中其它染料的信号强度。

由于臭氧存在大气中，在实验环境中很难检测它的水平。为此，SciGene开发了NoZone无臭氧工作台（http://www.scigene.com/），它是一个带有高效臭氧去除器的密封系统，包括一个臭氧过滤器和臭氧检测器，可以控制系统内的臭氧水平下降到5ppb以下。NoZone的臭氧去除系统使空气泵入催化床，将臭氧转变为氧后进入密封空间。正压的密封空间使得NoZone工作台内部维持低臭氧的水平。

要投资建立一个无臭氧的实验楼，无论在技术上还是经费上都是不现实的。SciGene开发的BriteSpot芯片工作站（http://www.scigene.com/）刚好满足了这个需求。该工作站包括了NoZone无臭氧工作台， Hybex芯片杂交工作站(可一次处理16张芯片的杂交)以及Little Dippe芯片洗涤工作站（可同时处理24张玻片连续进行 5种不同温度水浴的洗涤过程，并提供芯片的离心干燥功能），使得研究人员可以在一个安全臭氧浓度的环境中完成芯片研究的所有实验，保证结果可靠性。

（NoZone Workspace）

斯坦福大学的博士后研究员Rubins认为，NoZone工作台使得她的小组可以去除工作台的臭氧。这使得该小组将5ppb的条件作为一个标准对照。“我们在5ppb浓度的臭氧条件下做了几次重复芯片杂交实验，然后扫描，将该结果的信号值作为100％对照，” Rubins说。使用臭氧发生器，他们将臭氧水平增加到大多数实验室空气中的正常水平30－60ppb， 同时，他们还设置了高臭氧浓度水平：80－90ppb。在这几个水平下分别做了芯片杂交实验，然后扫描，得出的信号和对照水平进行了比较。

“我们发现了随着臭氧浓度的增加，Cy5信号逐渐下降。在30-60 ppb我们发现信号大概损失了40％，更加严重的是，在80-90 ppb水平下，Cy5信号损失了大概50％，”Rubins说。 如果你在一次实验中做完所有的芯片，这个问题不大，因为信号损失是一样的。但是如果你在不同的时间进行同一个芯片实验，或者在不同臭氧水平下进行的话，这个问题就比较严重。
（以上文章来自香港基因公司）