美研制出可设计基因片断的计算机程序

【字体: 时间:2006年03月01日 来源:中科院

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 据《基因组研究》杂志4月刊和2月中旬在线版的一文章报道,美国Johns Hopkins的科学家研制成功一种基于网络的自动化计算机程序“GeneDesign”。据称,该程序能大大地简化费时且易出错的人工基因片断的设计过程。

  到目前为止,研究人员已利用GeneDesign程序成功设计合成了许多基因序列,包括Ty1片断-酵母细胞中的一种运动性的遗传片断。该片断可从一个酵母细胞中移出来并插入到另外一个酵母的染色体上。这种“跳跃式”运动能产生突变,为酵母引入附加的遗传物质。

据了解,GeneDesign由6个模块组成,可单独或者一起自动完成基因序列的设计和处理工作。通过输入组成蛋白质的氨基酸序列或组成基因的碱基序列开始,接着需按一系列步骤完成,而且,用户也可以按主程序“基因设计”方式选择单个模块进行。

该研究的其他作者包括Johns Hopkins大学医学院的Sarah J. Wheelan和Robert M. Yarrington。

该研究由美国国立卫生研究院所资助。

 

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