科学家建立起900多种细胞受体模型

　　　　为加快药物开发研究，研究人员为900多种细胞受体建立起计算机模型。这些受体蛋白都是很重要的药物靶点。目前，这些模型对于非商业用户都是免费的，它不仅可以帮助科学家们缩小其研究范围，还能加快新的药物复合物的发现过程。这也是人们第一次在建立模型时，用计算机算法来提高其结构的精确性。该研究成果发表于2月17日科学公共图书馆的《计算生物学》杂志上。
　　作为在药物研究的热门区域之一，目前很多研究都使用三维计算机进行药物设计，模拟不同的药物和它们的细胞内靶物是如何相互作用过程。这项技术可以帮助研究人员发现什么样的复合物最有可能达到预期的作用，并能加快药物开发速度，还可能会发现传统的研究方法所不能发现的一些药物反应。
　　G蛋白偶联的受体（GPCRs）占目前已知药物靶点的约三分之一，它的作用主要是把细胞外的化学信号传递到细胞内。但是由于它一旦在细胞外膜上移动就会解体，科学家只能得到它们当中很少几个蛋白的三维结构，而且它们也不是很好的药物靶点。直到现在，研究者想要建立这样的一些模型也不得不利用现有的已知结构，而这些结构却不是药理学上的受体。因为根据Skolnick的理论，这些受体在进化上与那些可以作为很好的药物靶点的蛋白偏离很远，它们的结构还不够精确。利用他们发展的一种称为TASSER的算法，Buffalo 大学领导的研究小组建立了所有人类基因组获得的GPCRs中少于500个氨基酸的蛋白三维结构。
　　通过这种新算法解出结构的GPCRs，和已知的可以作为很好药物靶点的GPCRs有着相似的外形，它们的差异只是一些细节部分。但是正是这些细节，比如螺旋的包装、角度和大小，决定了不同的GPCRs的药物结合位点的不同。
　　Skolnick认为TASSER算法可以得到这些蛋白合理的结构图。TASSER已经帮助建立了907个蛋白模型，其中有大约820个的精确度研究人员设计药物试验有所帮助。
　　王杰译自：innovations-report网站 2006年2月17日