整合膜蛋白研究的新工具

　　生物通报道：新近网络版《PLoS Biology》一篇文章中，Gaby Sennhauser和 Marcus Gruetter等利用结构生物学技术（structural biology techniquest）探索大肠杆菌重要的药物外排泵（ efflux pump）AcrB的分子机制。

细菌对抗生素的抗性是目前治疗传染病的挑战之一。细菌逃避药物杀伤的一种方式是利用特异的跨膜蛋白（比如AcrB），将药物排出。

研究思路为设计一种蛋白，与目的蛋白结合并稳定目的蛋白，得到AcrB复合体的清晰结构。Sennhauser等筛选能够抑制AcrB的锚蛋白重复序列（ankyrin repeat proteins，DARPins），分析出DARPins抑制剂与AcrB相结合的复合体的晶体结构，证实AcrB泵由三个结构完全不同的亚基组成。

每个亚基都有其于众不同的底物传输通道，这些不同的通道使AcrB在底物传输过程不同阶段可依要求改变形状。

这种结构模型还解释了底物输出与同时发生的质子输入的结构上的相关性，有助于我们弄清AcrB机制。这是关于选择DARPin，并与膜蛋白共晶体的首次报道，不仅证明了DARPin作为抑制剂的可能性，而且为研究整合膜蛋白的结构提供了重要工具。（生物通记者 小粥）