美生物公司群雄逐鹿，100万美元大奖谁来拿？

生物通报道：100万美元重奖能够研制出“10天内完成100个人类基因组样本测序任务（覆盖率不小于98％，误差不大于1/10，000bp）”设备的第一支研究小组！当10月4日X大奖基金会（X Prize Foundation）宣布此项为基因组学设立的Archon X Prize时，即让人兴奋，又让人怀疑。《The Scientist》杂志专栏作者Jeffrey M. Perkel就此争论，给我们做了市场分析。

　　

生物通报道：100万美元重奖能够研制出“10天内完成100个人类基因组样本测序任务（覆盖率不小于98％，误差不大于1/10，000bp）”设备的第一支研究小组！当10月4日X大奖基金会（X Prize Foundation）宣布此项为基因组学设立的Archon X Prize时，即让人兴奋，又让人怀疑。

“这是无论如何也完不成的，”麻省理工学院和哈佛大学的Broad研究院（Broad Institute of MIT and Harvard）基因组测序和分析项目主任Chad Nusbaum说，“我们已经可以对一个基因组进行测序了，但是这些离这个要求还太遥远。”哈佛大学医学院遗传学教授George Church说人类基因组计划的覆盖率只有93％，出错率为1/10，000bp。Nusbaum补充说，人类基因组测序样本并不是来自于一个个体，“是几个个体来源的单模标本的拼接。”

《The Scientist》杂志专栏作者Jeffrey M. Perkel就此争论，给我们做了市场分析。

Perkel说：“我想知道的是，现在是谁在进行这种唐·吉呵德形式的quixotic X Prize”。几个被看好的竞争者：454 Life Sciences、Solexa、Helicos BioSciences、VisiGen Biotechnologies、Applied Biosystems和 Church中，454 Life Sciences和VisiGen Biotechnologies已经注测。

其它公司无角逐之意

新一代游戏玩家Applied Biosystems，当其在今年年初获得Agencourt Personal Genomics（与Church有联系）后，该公司高通量分析研发项目主任Gina Costa说公司决定放弃，不再打算将DNA测序技术商业化。Church也不会，其主打是个人基因组计划（Personal Genome Project），目标是完成个体样本1％的基因组测序（今年完成10个样本，尽快实现数百万样本）。当然，Church也表示，“假如某天我们突然说我们可以轻松摘得100万美元，相信也不会有人晕倒。”

Solexa副总裁和首席科技官Tony Smith绝句透漏其公司是否有意角逐。Helicos市场部高级副主席Steve Lombardi说他们还没有做最后决定。

几个公司最终的目的都是提高测序速度、降低测序成本。目标相同，利益类似是他们进入角逐比赛的动力 。VisiGen会长Susan Hardin说“X Prize与VisiGen的使命一致。”同样，454会长、CEO Chris McLeod说：“我们早已下定决心寻找快速、经济的测序全基因组的方法，我们参与竞争很正常。”

功能已知并且可以检测的遗传变异有几百个，但是其中只有一小部分有临床实践意义，比如syndromic loci和原癌基因。检测这些位点，我们不需要对全基因组进行测序，甚至真的不必研发下一代测序技术，除非是为了提高分析速度。假如我们真的能够将每种健康问题或者易患病体质都与我们的25，000或蛋白编码和调节RNA基因联系起来，也只能代表不到2％的人类基因组。

尽管目前我们对基因组的了解还很少，但公司角逐测序全基因组的动力是什么？Perkel 说：“我推测的几条原因，从弄清人类变化到改善癌症诊治。”大多数的观点是：尽管今天我们还用不到这些数据，我们收集的测序信息越多，后继实验所发现的问题也就越多。Hardin说：“全基因组测序的价值会随着比对的基因组数量的上升，日益凸显。”

另一个问题是：为什么将目标定的这么高？X Prize基金会公共关系主任Ian Murphy说：“关键是根本性的突破，除非我们有能力获得上百个基因组图谱，在几个小时内获得上百个基因组图谱，而不是几天、几个月、几年，我们是不可能使这种技术得到全面发挥的……我们不想增加目标，只是想改变我们的生活方式。”（生物通记者 小粥）

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