两篇《自然》子刊文章:miRNA最新研究

【字体: 时间:2006年11月01日 来源:生物通

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  在10月29日在线出版的《Nature-Genetics》杂志上,两篇来自不同研究小组的研究人员做出的研究报告中指出microRNA基因及其靶标基因仍然处于进化的状态

  

生物通报道:在10月29日在线出版的《Nature-Genetics》杂志上,两篇来自不同研究小组的研究人员做出的研究报告中指出microRNA基因及其靶标基因仍然处于进化的状态:

来自美国纽约州大学生物学系和德国马科斯-代尔不吕克分子医学中心(Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin, MDC)的研究人员利用基因分型的数据发现预测microRNA靶位点是在达尔文选择负压下,而来自荷兰皇家科学院(Hubrecht Laboratory–KNAW)和德国的研究人员则是利用一种大型平行测序方法(massively parallel sequencing approach)获得了几百个候选microRNAs,发现其中许多在人类,灵长类,或者脊椎动物中是有限的。

链接:
K. Chen, N. Rajewsky, 
Natural selection on human microRNA binding sites inferred from SNP data,
Nature Genetics, advance online publication, Oct. 29, 2006. doi:10.1038/ng1910
[Abstract]

E. Berezikov et al., 
Diversity of microRNAs in human and chimpanzee brain,
Nature Genetics, advance online publication, Oct. 29, 2006. doi: 10.1038/ng1914
[Abstract]

具体而言,在前一主要针对自然选择对基因调控进化的影响方面的研究中,研究人员利用SNP分型数据和群体遗传学中的方法对整个人类基因组短的顺式调控位点(顺式作用元件是同一DNA分子中具有特殊功能的转录因子DNA结合位点和其它调控基序,在基因转录起始调控中起重要作用)进行了完整分型,尤其是其中通过3' UTRs顺式元件转录后抑制mRNA的一组小分子RNAs:miRNAs。

研究结果表明计算预测的人类保守性miRNA结合位点要比其它保守性3' UTRs序列区域更多的出现负选择(negative selection),而且有趣的是,根据非保守性的miRNA结合位点的研究,研究人员估计当mRNA和miRNA内源性共表达的时候,其中30%–50%的miRNA结合位点是有效的。这些结果说明由于预测性miRNA结合位点的多态性是趋向有害的,因此在检测人类疾病方面可能会是候选的靶标。

而后一篇针对人类和黑猩猩大脑miRNAs比对的文章中,研究人员发现许多灵长类进化以上的新miRNAs不是保守的,这说明这些miRNA起源比较晚,而且一些miRNAs是种族特异性的,但其它的通过复制过程在物种中出现了延伸,这些数据说明miRNAs的进化还在进行,并且除了一些古老的高保守性的miRNAs,也出现了一些新miRNAs。
(生物通:张迪)

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