三篇RNAi文章角逐 谁是国内RNAi技术高手？

三篇RNAi文章角逐 谁是国内RNAi技术高手？

　　

【编者按】：为了鼓励更多的优秀论文在国内的核心刊物发表以及鼓励和发掘极具潜力的青年科学家，表彰优秀的实验成果，国内的一些知名核心期刊、生物产品厂家与生物通联合举办了中国05-06生命科技年度优秀论文评选活动。此次评选活动已经进入了决赛阶段，最后“万”元大奖的获得者将从50多篇文章中诞生，这些文章都是由国内颇具实力的实验室完成，其中包含了同一领域研究内容，从实验设计到方法运用到底谁会胜出呢？以下是生物通个家意见，仅为评论，不做依据。

候选优秀论文：

RNA干涉（RNAi）技术应用于哺乳动物细胞的研究策略   [投本文一票] 

RNAi技术在转基因动物中的应用  [投本文一票]

RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因  [投本文一票]

　

[文章简介]

RNA干涉（RNAi）技术应用于哺乳动物细胞的研究策略 

实验室：华中农业大学动物科技学院动物分子生物学与育种实验室，中国农业科学院畜牧研究所（张定校，樊斌，刘榜，李奎）

基金项目：国家自然科学基金（编号：30300250），国家重点基础研究发展规划（编号：G2000016103）和“863”项目（编号：2004AA222170）

摘要：RNAi作为新近发展起来的基因功能分析技术，近年来在哺乳动物细胞中的研究已取得了长足进展，且有着广泛的应用前景。对RNAi作用机制及RNAi实验操作技术的探讨是目前研究的热点。研究表明，哺乳动物细胞中的RNAi作用模式与植物有所不同。文章对RNAi作用机制、哺乳动物细胞RNAi实验的一般策略（包括靶siRNA序列选择、siRNA获取方法、siRNA转染、RNAi效果检测等）以及最新研究进展进行简述，以供类似工作的参考。 

RNAi技术在转基因动物中的应用

实验室：军事医学科学院放射与辐射医学研究所（尹秀山，张令强，贺福初）

基金项目：国家自然科学基金（编号：30321003），国家863计划课题（编号：2004AA221100，2002BA71A02-5）

摘要：RNAi可以作为一种有效的工具用来产生转录后沉默的效果，从而抑制特定基因的表达，已经在线虫、果蝇、小鼠、大鼠等模式生物中得到成功应用。RNAi转基因小鼠的出现，使得在哺乳动物整体水平研究靶基因的敲低成为可能。文章以RNAi转基因小鼠为代表，就转基因载体的设计策略、基因敲除与基因敲低的比较、RNAi转基因动物的优势以及目前存在的缺陷等作一总结，并展望了RNAi转基因动物对功能基因组研究的贡献以及应用前景。

RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因

实验室：教育部发育与疾病相关基因研究重点实验室，江苏省基因诊断与治疗医学重点实验室，东南大学遗传学研究中心（许军，樊 红，赵主江，张建琼，谢维）

基金项目：教育部高校青年教师奖（编号：2001/182），国家自然科学基金项目（编号：30470950）

摘要：为揭示DNA甲基转移酶3B（DNMT3B）在肝癌中是否参与了肿瘤的发生，应用Western blotting及细胞免疫化学方法分析DNMT3B蛋白在人的正常肝细胞株、肝癌癌旁细胞株及肝癌癌细胞株中的表达。构建了DNMT3B 的RNAi稳定表达的重组载体，并转染入肝癌细胞株SMMC-7721中。以半定量RT-PCR及Western blotting分别鉴定DNMT3B RNAi表达载体对内源性DNMT3B的抑制效率。用高通量的cDNA基因芯片分析了SMMC-7721中DNMT3B抑制后有影响的下游基因谱。结果显示，DNMT3B在肝癌细胞株中的表达水平明显高于肝癌癌旁和正常肝细胞株。DNMT3B 的RNAi稳定表达重组载体转染SMMC-7721细胞株2个月后，观察到DNMT3B明显的受到抑制。cDNA基因芯片分析发现，DNMT3B抑制后诱导了26条基因表达下调，115条基因表达上调,包括一些发育相关基因以及肿瘤相关基因，如SNCG、NOTCH1、MBD3、WNT11、MAOA、FACL4等。提示DNMT3B的高表达可能与肝癌的发生有关，并以调控其它相关基因的表达而起作用，包括与发育相关的重要基因。

　[研究内容&技术方法PK]

这三篇文章内容都集中在生命科学和生物技术“新贵”：RNAi上，第一篇和第二篇均是RNAi技术应用综述性文章，第三篇则具体范例了RNAi技术在癌症研究方面的运用。

从内容上来说，《RNA干涉（RNAi）技术应用于哺乳动物细胞的研究策略 》从RNAi机制，到RNAi技术在哺乳动物细胞中的5个实验策略：制备siRNA，siRNA转染哺乳动物细胞和RNAi效果分析都进行了详细的讲解，是篇对于RNAi技术新手具有指导意义的文章。而《RNAi技术在转基因动物中的应用》的侧重点在于转基因动物应用，也对转基因载体的设计策略、基因敲除与基因敲低的比较、RNAi转基因动物的优势以及目前存在的缺陷进行了综述性讲解，从这些方面而言，这两篇文章给予相关研究领域的研究人员指导意义较大。

在技术方法方面，《RNAi及DNA芯片分析肝癌细胞系中受DNMT3B调控的下游基因》演示了一次RNAi技术的具体范例实验，并且以较高的技术水平和问题解决能力显示了这一实验的各方面研究成果，也对于肝癌研究和RNAi技术操作具有积极的意义。而《RNA干涉（RNAi）技术应用于哺乳动物细胞的研究策略 》也是从具体详细的设计方案设计入手，进行了指导性的技术讲解，指出了在进行RNAi实验设计过程中需要注意的细节问题。

这三篇文章对于从事RNAi技术的研究人员来说都是颇值一读的文章，不同的研究领域的研究人员对于这三篇文章也会有自己不同的看法，这里仅根据文章的内容和方法进行了粗略的比较，如果您有更具体的看法，欢迎到BBS中留言。
（生物通：张迪）