生物通综合:蛋白质结构计划 (Protein Structure Initiative;简称PSI) 是一项起源于2000 的中长期研究计划,在历经六年的开创期之后,相关研究领域的科学家,开始从这个锁定蛋白结构的数据库中,获得许多资源共享的珍贵成果。
据了解这个由美国国家卫生研究院 (National Institutes of Health)的国立综合医学科学研究所 (National Institute of General Medical Sciences)所赞助的研究计划,打从一开始,就锁定发展解析蛋白结构为目标,参与计划的研究单位与科学家,一方面发展最尖端的自动化结构结晶技术,同时也发展更快速方便的晶体解析软件,另一方面则开始建立这项研究资源共享的接口,希望透过这样的努力,能将蛋白结构的这个资源 分享给所有的研究单位。
主导该计划的 John Norvell博士表示,目前该计划不但已经建立了10万个蛋白结构先导计划的资料(PSI-Materials Repository) ,还以每年两万个的速度不断的增加,除此之外该计画的研究单位,还可以接受委托定制特定的蛋白克隆 (clone),生产足够蛋白结构解析的蛋白质,将研究单位面临最耗时,最不经济的蛋白结晶问题承接起来,因此相关的科学家预期生物医学相关的领域,将因为这个大型研究资源的建立,大幅的加快研究的速度。
附:
美国蛋白质结构计划进入第二阶段
美国的蛋白质结构计划(PSI,Protein Structure Initiative)计划在十年内确定出一万个蛋白质的三维立体结构。随着10个新的研究中心的加入,这个项目也宣告进入了第二阶段。这种结构信息将有助于揭示出蛋白质在健康和疾病中的作用,并且有助于指引出设计新药物的途径。
这些新中心的选择(被选出的中心将会在未来的5年内接收到大约3000万美元的研究经费)标志着研究进入了十年计划的第二个阶段。这项计划主要由NIGMS资助,部分由NIH资助。
PSI于2000年建设自己的“引航”中心时,其目的有两个:开发出新的方法和工具,如能简化和加速产生蛋白质结构步骤的自动化设备;另一个目的就是将这些新方法用于将DNA序列信息转变成蛋白质结构的途径中。
现在,项目的焦点进入了一个生产阶段:新加入的中心将使用“引航”阶段开发的新方法和工具确定从细菌到人类的各种生物体内的成千上万种蛋白质的结构。这些研究将便利通过计算机模拟方法来确定更大量的蛋白质结构的研究。
PSI已经将蛋白质结构的确定转化成一种高度自动化的过程,从而能够比以往更迅速地从一个选定的靶标过渡到一个完成的结构。基于这些成果,新的研究中心将使PSI进入到一个新的水平、产生出大量的结构并克服重要的新挑战