本期《科学》专题:基因组的故事

【字体: 时间:2006年10月08日 来源:生物通

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  我们的器官在讲述着故事,比如说一个病理学家可以通过肺部讲述出一个在矿厂辛苦工作的矿工的一生;我们的基因也有故事。通过比较越来越多品种生物的基因组序列,我们正一步步地发现我们的身体是如何演变成现今的组成。进化是一个缓和紧张关系的故事,对变化环境的适应是与功能严密的生物机器需求的一场拉力战。

  

生物通综合:我们的器官在讲述着故事,比如说一个病理学家可以通过肺部讲述出一个在矿厂辛苦工作的矿工的一生;我们的基因也有故事。通过比较越来越多品种生物的基因组序列,我们正一步步地发现我们的身体是如何演变成现今的组成。进化是一个缓和紧张关系的故事,对变化环境的适应是与功能严密的生物机器需求的一场拉力战。

在本期的《Science》杂志上,基因组进化上的故事通过三篇综述和一组新闻缓缓的道来:

REVIEW
Russell D. Fernald (29 September 2006)
Science 313 (5795), 1914. [DOI: 10.1126/science.1127889]
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REVIEW
Derek Lemons and William McGinnis (29 September 2006)
Science 313 (5795), 1918. [DOI: 10.1126/science.1132040]
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REVIEW
Eric N. Olson (29 September 2006)
Science 313 (5795), 1922. [DOI: 10.1126/science.1132292]
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另外还有一篇研究文章,讲述的是“Connectivity Map”的故事:来自麻省理工学院和哈佛大学的Broad研究院(Broad Institute of MIT and Harvard),Dana-Farber癌症研究所和波士顿儿童医院(Dana-Farber Cancer Institute,Children's Hospital Boston)等处的研究人员报告了建立大规模的药物如何影响健康和疾病细胞数据库的初步成果。他们称这个项目为“联系图”(Connectivity Map),因为它有揭示药物、基因、与疾病之间联系的能力。这些研究成果分别公布在9月29日Science杂志和9月28日Cancer Cell杂志上的三篇文章中。详细内容>>

而同样来自麻省理工学院和哈佛大学的Broad研究院(Broad Institute of MIT and Harvard)的Antonis Rokas则在一篇研究评述(Genomics and the Tree of Life)中写道,虽然第一个基因组是在10年前的测定,但是基因组已经对系统分类有了很大的影响。基因组数据使研究人员发现了建立生物之间早期关系的新的标记。大量的数据给系统分类建设的推断以更多的信心,但也带来了挑战。研究人员需要更大的计算机和新的统计算法来处理这些数据。有些棘手的问题也变得更清楚,包括某些基因历史看起来更像进化网络而不是树。比较基因组学将使可以得到的分子数据极大地增加,从而在组建一个更清晰的生命之树上起关键作用。

确实,通过比较基因组学,科学家正在了解哪些影响促进多样性或给我们的生物机器施加约束。比较基因组学也给人类生理的进化历史提供了线索,同时可能会提示治疗疾病的新方法。 
(生物通:万纹)


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