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又发现七个蛋白质“内含子”——Intein
【字体: 大 中 小 】 时间:2006年10月31日 来源:生物通
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生物通报道:Intein是一个自我拼接的蛋白质元件,类似于基因组中的内含子intron在RNA的剪接中所起的重要作用。Intein如同一个插入宿主蛋白的肽段,进行自我切除,并用一个肽键将两端的宿主蛋白(extein)连接起来。10月27日《BMC Biology》一篇文章报道说,Timothy J. D Goodwin等研究人员在编码RNA聚合酶(RNA polymerase)第二大亚基的核基因中鉴定出7种Intein编码序列。
生物通报道:Intein是一个自我拼接的蛋白质元件,类似于基因组中的内含子intron在RNA的剪接中所起的重要作用。Intein如同一个插入宿主蛋白的肽段,进行自我切除,并用一个肽键将两端的宿主蛋白(extein)连接起来。负责编码Intein的基因也如同框内插入(in-frame insertions,生物通编者译)宿主基因的一段蛋白编码序列。Intein在植物、动物、真菌和病毒中都有出现过,但是分布零散。在真核基因中只鉴别出一小部分的Intein编码序列,并且都位于担子菌 (basidiomycete )和子囊菌(ascomycete )真菌中。
10月27日《BMC Biology》一篇文章报道说,Timothy J. D Goodwin等研究人员在编码RNA聚合酶(RNA polymerase)第二大亚基的核基因中鉴定出7种Intein编码序列。一个位于子囊菌亚门真菌Phaeosphaeria nodorum的RNA聚合酶Ⅰ第二大亚基(RPA2);一个位于粘菌Dictyostelium discoideum的RNA聚合酶Ⅲ(RPC2),四个分别位于位于绿藻Chlamydomonas reinhardtii、接合菌Spiromyces aspiralis、壶菌Batrachochytrium dendrobatidis 和壶菌 Coelomomyces stegomyiae的RNA聚合酶Ⅱ;第七个Intein编码序列,是插入霉菌Phytophthora ramorum基因组的病毒遗迹。
Chlamydomonas和 Dictyostelium的Intein是首次发现的真菌以外的核编码Intein。这些新发现的Intein代表了一种独特的数据:它们出现于同源蛋白中,构成一个平行组(paralogous group),尽管这些平行相关蛋白在真菌进化早期阶段即已开始出现差异,但是它们的序列长度变化很小。Intein可插入多个不同的位点,每个都负责编码RNA聚合酶的高度饱受区域。这些资料支持了早期的一个观点:Intein青睐于它们宿主蛋白的高度保守区域。
这些新鉴定的Intein,拓宽了真菌Intein序列的宿主范围,对Intein的起源和进化有了更深入的了解。研究人员认为,Intein是曾在真核微生物中广泛存在的远古真核细胞成分。它们在微生物的基因组中一直很稀少,占据不同蛋白的高度保守位点。(生物通记者 子元)