基因组测序方法的进一步跨越

　　

生物通报道：一项数学发现已经将一种新的基因组测序方法延伸至人类，并可能为癌症生物学研究提供一种比传统DNA测序技术更快、更便宜的工具。

 

一个由USC大学Micheal Waterman实验室的一名学士领导的研究组开发出了一种能够分析大量由限制性内切酶图谱技术（可见图谱optical mapping）获得数据的新运算方法。

 

这名叫Anthor Anton Valouev的学士是Waterman实验室的一名新毕业的研究生，目前在斯坦福大学做博士后。他说，这种运算方法可能使可见图谱方法用于人类基因组。这种方法对医学研究具有重要意义，尤其是寻找基因组的异常方面。研究人员将这种运算法则公布于近期的《美国科学院院刊》网络版上。文章的共同作者是威斯康星麦迪逊大学的华裔研究人员周施国（Shiguo Zhou,音译）。

 

可见图谱（optical mapping）由纽约大学的David Schwart在二十世纪九十年代后期发明，现在他世威斯康星－麦迪逊大学的化学和遗传学教授。

 

可见图谱的强大力量在于它能够揭示出一个基因组的大小和大规模结构。这种方法利用荧光显微镜来显像个体DNA分子，而这些DNA分子已经被限制性内切酶切割成了有序的片段。

 

通过成像一个生物体中大量的DNA分子，可见图谱能够以更低的成本产生出基因组的一个图谱。（生物通杨遥）

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