瑞典科学家绘出蛋白质图集
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时间:2005年09月06日
来源:科学时报
瑞典的蛋白组研究人员计划于近日发布一个数据库,其中包括几千张人类细胞和组织中各种蛋白质的图片。这个数据库被称为“蛋白质图集”,目的是协助生物化学家识别新发现的蛋白质的功能。
瑞典斯德哥尔摩皇家技术研究院的微生物学家、“蛋白质图集”项目负责人Mathias Uhlén指出,从20世纪90年代起,科学家们开始测定人类基因序列,确定每个基因编码的蛋白质在细胞中的位置成为当务之急。他说,图集能通过提供有关蛋白质功能的线索,推动它们成为疾病标志或药物靶物质。两年前的一次小规模试验使瑞典Knut和Alice Wallenberg基金会决定,为一个持续到2007年9月的大规模“蛋白质图集”计划提供资助。
为了确定蛋白质在人体组织内的定位,Uhlén小组的100多名科学家将这个问题分成两部分——找到每种蛋白质的抗体,然后利用抗体寻找组织内的蛋白质。Uhlén小组创造出一系列标准物,其中含有48种正常人体组织和20种肿瘤组织的微样品,这样可以使研究过程变成流水作业。给抗体作好标记,以便弄清每种组织中所表达的蛋白质。尽管这套新图集目前只包括大约700种蛋白质,但研究小组将继续添加22000种左右的蛋白质,每个人类基因对应一种蛋白质。
美国耶鲁大学的Michael Snyder正在领导一个大规模酵母蛋白定位计划,他表示:“这是你能得到的最有价值的数据库之一。”在判断蛋白质是位于细胞核、细胞膜还是其他部位的过程中,酵母菌的数据库已被证明是一种缩小定位范围的必要工具。
“蛋白质图集”还有些地方需要确认。如果抗体与一种以上的蛋白质反应,组织定位可能会无意中指向其他蛋白质。Uhlén小组将另请专家来解决这个问题。
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