科学家构建出果蝇基因组物理图谱

　　

生物通报道：由Universitat Autònoma de Barcelona的Alfredo Ruiz教授领导的一个国际研究组在6月的Genome Research上公布了果蝇Drosophila buzzatii染色体的第一个详细的物理图谱。这种果蝇在全世界被用作进化遗传学的一个研究模型。

这项研究包括两个步骤。首先，研究人员构建了一个基因组库。这个文库包含了超过18000随机被插入细菌细胞中的这种果蝇基因组片段。每个细菌克隆携带这些DNA片段的其中一个（长度大约为150000个核苷），并且能够在实验室中扩增以增加果蝇的DNA。

研究人员的第二步是按照这些片段在完整的染色体中的顺序和位置来排列文库中的这些随机片段。为了完成这个任务，他们使用了两种方法。第一种方法叫做“指纹识别”：包括将原始的克隆切割成更小的片段，然后用电泳法对这些片段根据尺寸进行排列。通过计算机对不同克隆的切割片段进行比较能够确定出哪些克隆有重叠并属于同一个染色体区域。

第二种方法需要将这些基因组克隆与果蝇幼虫的巨大唾液腺染色体进行杂交，即“原位杂交”（in situ hybridization）技术——能够确定每个克隆的染色体位置。

Drosophila buzzatii基因组的这个物理图谱是到目前为止最为详细的果蝇图谱。现在，由于这个基因组文库和物理图谱的构建，国际研究团体将能更容易对这种果蝇和相关的种类的基因组进行比较并在这些种类的基因组完成测序时构建出这种图谱（记者杨淑娟）。