蛋白结构分析进入第二阶段

　　

生物通报道：随着十家研究中心的宣告成立, 美国NIH发起研究发现蛋白广谱3D结构的第二个阶段。这将有助于揭示蛋白结构在健康与疾病中扮演的角色，并且为研究设计新的药物提供途径。

 

大量研究蛋白质构造远比大量DNA序列测序来得困难的多，因为DNA只是由四个碱基组成而产生的直线序列，而蛋白质则是由二十种氨基酸组成而在立体空间上折叠产生复杂之席状(sheets) 和弯曲(loops) 构造。如果想直接从DNA序列而去预测蛋白质立体构造，即使利用计算机辅助，就算是只是一个最简单的蛋白质，也是一项相当艰难的事。基于蛋白质三度空间立体结构的确定如此不容易，因此自1957年第一个蛋白质myoglobin之立体结构被确定以来到现在，大约只有12000个蛋白质之立体结构被确定出来且被输入国际公开性蛋白质构造储存库(Protein Data Bank) 。

 

2000年NHI建立PSI（the Protein Structure Initiative）初衷有两个，其一是发展新型的研究手段与工具，比如说机器遥控设备（可以使蛋白结构测序流水线化）；另一个目的是利用一些新方法研究DNA序列信息与蛋白结构的关系。如今，发展到这第二阶段，重点已转移到了一个生产的阶段。新的研究中心将利用在第一阶段确立的方法快速的对包括细菌到人类中的大量生物体蛋白进行测序，确定其蛋白结构。这将推动通过计算机模拟非常多的蛋白的结构确定(记者Leslie）。

 

这十家研究中心分别是：

 

1. 大规模中心：

联合结构基因组学中心（Joint Center for Structural Genomics）

中西结构基因组学中心（Midwest Center for Structural Genomics）

纽约结构基因组学研究机构（New York Structural GenomiX Research Consortium）

东北结构基因组学协会（Northeast Structural Genomics Consortium）

 

2. 专项研究中心：

 

基因3D结构加速科技研究中心(Accelerated Technologies Center for 3D Structrue)

真核结构基因组学中心（Center for Eukaryotic Structural Genomics）

高通量结构生物学中心（Center for High-Throughput Structural Biology）

膜蛋白结构学中心（Center for Structures of Membrane Proteins）

结构与功能创新综合中心（Integrated Center for Structure and Function Innovation）

纽约膜蛋白结构学协会（New York Consortium on Membrane Protein Structure）