流感病毒：未来谁领风骚？

　　

生物通报道：在众多甲型流行性感冒病毒（influenza A viruses）中最近估计要属禽流感亚型H5N1最出风头了。许多种不同的流感病毒会同时在传播着，它们的基因有可能会在这个过程中重新“洗牌”，产生新的病毒，其中的一个可能会在人类中造成大范围感染。那么下一个最有可能造成大范围感染会是哪一种病毒呢？最近来自基因组研究所的Edward Holmes，David Lipman和他们的同事利用分子进化方法对病毒序列进行分析，对在未来流感即将爆发的季节中可能影响最大的病毒株进行了预测，并帮助设计更有效的流感疫苗。文章发表在PLoS Biology上。

 这是第一次大规模的对流感病毒基因组进行测序，研究人员对收集自1999年到2004年期间156株甲型流感病毒H3N2血清型的病毒株进行了测序。他们发现一些最初感染能力不是十分强的共流通产生的进化树上的分支（clade）可能成为下一个造成流行病的菌株。

 之前就在猪身上同时检测禽流感病毒和感染人类的流感病毒，科学家就曾经警告过两种病毒在同一物种身上出现可能会有遗传信息的交换从而导致新型的流行病毒出现。详细关于猪的报道可以参见，六月聚焦：猪之歌<http://www.ebiotrade.com/custom/ebiotrade/6th/>

 在这项新的研究中进一步的证实了这个想法。从单个基因片段的分子进化树的分析发现在这些不同的分支中的确存在重排的现象，比如抑制自从2000年就出现的H3N2病毒分支为在2002-2003流感爆发季节采集样本的H3N2病毒提供了红血球凝聚素基因。这次重排事件可能导致了2003-2004年间福建株样本表面抗原的变化(生物通记者 谢菲)。
 

以上是利用最大似然法对156株甲型流感病毒构建的系统分子进化树