细菌从哪里获得它们的基因？

　　 

生物通报道：据亚利桑那州大学的一项研究显示，细菌的高达90％的遗传物质是从亲缘关系远的细菌物种那里获得。由于基因交换（gene swapping）是许多病原细菌获得抗生素抗性或更加毒性的一种途径，因此这一发现具有重要的生物学意义。这项研究的相关文章发表在近期的Plos Biology上。

为了保持治疗的有效和开发新的抗生素，监控横向基因转移（lateral gene transfer）发生率和形式非常重要。这项新研究还破解了一个长时间困惑着人们的疑团：许多研究人员认为传统的家族树不适用于细菌，因为它们的基因组是来自它们亲代细胞和其他细菌种的遗传物质的混合体。

现在，Ochman和同事的研究表明细菌血统仍然能够通过只考虑基因遗传的“传统”形式来追踪。因为获得性基因在之后的一个特定时间点上会丢失，因此广泛的基因交换并不会弄乱它们的血统。如果这些基因没有丢失，那么细菌就会将其传递给后代。

细菌世界独有的横向基因转移常常被认为很普通。但是直到现在研究人员还不知道细菌的哪些基因来自横向基因转移、哪些来自它们的亲代。

在这项研究中，研究人员集中调查了了解最多的Gamma-Proteobacteria。这类细菌包括许多人类病原菌，如沙门氏菌、Shigella、大肠杆菌和假单孢杆菌。研究组比较了通过分析基因组序列信息比较了这些细菌类型。接着，他们用计算机绘制出家族树（考虑上了获得的基因），并且和已经建立的参考树进行了比较：他们发现所有基因的相配率高达95％。这意味着广泛的横向基因转移机制并没有干扰利用家族树推断关系的传统方法。研究组的这些发现将会引发对细菌进化的新一轮研究热潮（记者杨淑娟）。