“色盲”方法为DNA测序开启新的大门

　　 

生物通报道（记者杨淑娟）：美国贝勒医学院（BCM, Baylor College of Medicine）和莱斯大学的研究人员研制出了一种“色盲”荧光检测方法。这项研究为DNA测序用于人类疾病临床治疗打开了新的大门。这一发明将使测序更加简便和快捷。研究的相关文章发表在本周的Proceedings of the National Academy of Sciences上。

在常规的DNA测序过程中，研究人员首先从细胞核中提取DNA并通过复杂的细菌克隆和/或PCR步骤将它的长度缩短到几千个核苷的尺寸以便于操作。利用天然的复制酶将DNA用四种染料荧光进行标记——每种染料对应特定的核苷。这种标记过程（也就是Sanger测序法，生物通注）会产生较小的DNA片断，然后这些较小的片断的碱基被逐个分开。由于DNA片段标记有染料，因此在用激光照射时会发光从而帮助确定DNA序列的顺序。

这种技术的一个常见问题就是染料发出的光的颜色很相似。即使用很复杂的计算机程序来协助信号的鉴别，这种不同染料间的交相互应导致的微小变化会导致核苷酸测定的错误。

BCM和莱斯的这种新方法叫做脉冲多线激发（PME，pulsed multilane excitation,生物通注）它利用四种激光——每种与一种特定的染料相配。PME能使研究人员利用整个可见光光谱，从而消除了染料间的交互问题。

由于使用四种激光，研究人员能够操作这个系统以使每种染料能够发出同样强度的荧光信号，因此无需进行进一步的信号处理。而且，PME能够产生更亮的信号并且能收集更多的信号，因此使提高了DNA测序的灵敏度和精确度。