研究人员改良DNA芯片分析
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时间:2005年12月13日
来源:生物通
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DNA芯片是研究人员用于分析DNA表达情况的常用工具。最近,一种用于检查电子邮件传输过程中是否出错的标准网际网络协议触发了研究人员利用一种革命性的新方法转换DNA芯片分析的灵感。这种新方法整合了实验和计算,从而促进了DNA芯片分的析。这项研究的结果公布在12月的Nature Biotechnology杂志上。
生物通报道:DNA芯片是研究人员用于分析DNA表达情况的常用工具。最近,一种用于检查电子邮件传输过程中是否出错的标准网际网络协议触发了研究人员利用一种革命性的新方法转换DNA芯片分析的灵感。这种新方法整合了实验和计算,从而促进了DNA芯片分的析。这项研究的结果公布在12月的Nature Biotechnology杂志上。
这个新方法结合了新的实验程序和一种新的计算方法,从而增加了辨别基因活化的DNA芯片分析灵敏度和特异性。这种经改良的DNA 芯片分析方法对于医疗和疾病研究的应用范围更广,而且效率更高。
由于DNA芯片只能提取基因活动的静态快照,但是在这些快照之间,基因可能发生了活化而研究人员却未发现。通过使用通讯协议,将增加检测任何基因表现的整体灵敏性。
这个通讯协议最初是用于确保电子邮件在网络传输时不会被断章取义而有所遗漏。依据0与1的判读,可以让接收者的计算机确定是否准确接收了信息;如果没有收到完整邮件,接收者的计算机会请求发信者的计算机再传送一次消息。
利用这个原理可以检查芯片快照是否有遗漏、计较不同时间里DNA芯片信息点总和与总信息结果。如果两个结果是相等的,那么DNA芯片的采样可代表真正的分析结果;两者不符则表示错过了某处的基因活化。(生物通记者杨遥)
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