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Cell新版块1年4篇,华人学者先拔头筹
【字体: 大 中 小 】 时间:2005年11月11日 来源:生物通
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今年,《Cell》杂志有了一项创新之举,就是在杂志中加入一个新的版块,叫理论(Theory)。10月21日,杂志刊登了理论版块的第一篇论文《以结构为基础推算F1-ATP合酶合成和水解ATP工作模式》(A Structure-Based Model for the Synthesis and Hdrolysis of ATP by F1-ATPase)。论文以一些现有的实验数据为基础推算出生命的分子马达ATP合酶的工作模式,作出同等贡献的第一、第二作者都是在美国的华人科学家。详细报道可见:Cell新版块首篇论文:华人学者文章。
这篇文章可以说与以往以实验为基础的论文有本质的区别,对于许多做实验起家,化学基础并不扎实的研究人员理解起来也许有些困难。在信息量不断增大的今天,《理论》版块的文章是不是可以理解为是生物信息学方面的论文呢?带着许多疑问,生物通的记者采访了10月底进行了一次中国之行的《Cell》杂志执行编辑Emilie Marcus女士。
Cell执行编辑Emilie Marcus女士
生物通记者(后简称生物通):最近了解到《Cell》开辟的一个新的名为《理论》的版块,不知道这是怎样的一个版块?
Emilie Marcus(简称Marcus):The new "Theory" format is intended to focus on work that synthesizes existing scientific data to propose a new testable hypothesis for a given biological process. In some cases the approach may be computational, mathematical or bioinformatic, but in some cases it may also be a conceptual synthesis of mutiple distinct experimental findings that when taken together promote a new way of thinking about a problem.
译文:新的理论版块的论文主要是针对一个特定的生物过程,综合已有的实验数据作出一个新的、可测试的假设。可以利用的手段包括计算机、数学或者生物信息学方法,但是在某些情况下它也可以是许多不同实验结果在概念上的综合,只要这些实验结果放在一起是可以对一些问题提出新的解决办法的。
生物通:由于现在研究的信息量越来越大,因此产生了生物信息学,这门科学主要是利用计算机手段对数据进行处理分析,并作出一些假设、推论。那么《理论》版块中的文章会主要介绍生物信息学上的发展的吗?
Marcus:Most traditional purely bioinformatic papers such as those reporting cluster analyses of gene lists would not be strong candidates for this format, but we do not rule out that a bioinformatic approach may be used to develop a new testable theory that provides a significant conceptual advance in how we think about a biological process and as such might be appropriate for this format.
译文:一些传统意义上、仅仅是生物信息学的文章,比如:对多条基因序列进行多序列比对*的文章是不大可能出现在这个版块中的。但是我们也不会排除利用生物信息学方法来发展一种新的、可测试的理论,只要这种理论让我们对一些生物过程有概念上的重新思考,那么这些文章也是可以接受的。
*生物通注:cluster为使用较多的多序列比对软件。
生物通:《理论》版块会每期都有吗?
Marcus:We expect to publish only 4-6 Theory articles per year so competition for space is likely to be quite high.
译文:预期每年只会有4-6篇《理论》文章,所以竞争是十分激烈的。
生物通:谢谢您回答我的问题。
Marcus:I hope this information helps to clarify the nature of the format and I appreciate your interest in the journal.
译文:希望这些信息可以帮助大家了解这个新版块的本质,同时感谢生物通对《Cell》杂志的关心。(生物通记者 谢菲)