识别所有表达基因的新技术

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[生物通讯]Ludwig癌症研究所和国家癌症研究院的研究人员利用一种强大的新技术识别出单一细胞中所有表达的基因。这篇发表在本周美国《国家科学院院刊》（PNAS）上的新研究指明了了解人类基因组所需的数据类型。

“既然我们已经知道了人类基因组大约有35,000个基因，下一步就是确定这些基因在健康和患病细胞中的行为。”研究的第一作者、Ludwig 癌症研究所瑞士分所的Victor Jongeneel博士说。

分析两个不同的细胞系（一个取自正常乳房组织，另一个取自结肠癌），研究小组发现每个细胞都表达10,000到15,000 个基因，这说明人体细胞可能只利用了基因组中所有基因的三分之一到一半。

而且，研究人员还发现，将近60％的基因表达很弱，以至于如果不是采用一种叫做“大规模平行信号测序”（Massively Parallel Signature Sequencing ，MPSS）的新测序方法根本不可能检测到它们的活性。这项技术可以跟踪一个拷贝的信使RNA，信使RNA是一个特定基因全部活性的指示器。

“这是首次对基因表达进入如此深入的分析。”Ludwig癌症研究所的Andrew Simpson说。“这项研究提示我们，还有大量关于基因功能的秘密等着我们去发现。”

MPSS 技术确实发现了更多基因活性的证据。根据与已知基因不匹配的信使RNA序列标签，研究人员计算可能有2,000个有活性基因，但仍然无法解释这两个细胞系中的一些基因。

鉴于绘制个体细胞类型基因表达谱的重要性和昂贵费用，研究人员号召建立一个与人类基因组计划建立的数据库类似的公共MPSS 数据库。

“显然，这类信息还有巨大的潜在价值等待我们去开发。”Jongeneel博士说。（生物通编译）