创造一个生物信息的国度

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就如同中世纪和文艺复兴早期的意大利被众多相互敌对的城邦所割据般，目前的生物信息领域亦被互相竞争的不同集团所掌控，而且各有各的网址，以及服务和资料格式。此种现象固然使得该领域显得多采多姿，但是对于想要充分利用这些丰富基因体资料的研究人员却是显著的障碍。就如同意大利最后终于统一成一个有力而安定的政体，希望藉由通用编码的使用，来使生物信息也同样地成为一个安定而有力的领域。目前有关人类基因体的众多线上资料来源的使用者界面各不相同，而且每个不同物种的生物数据库亦均有其各自的使用者界面和格式。有鉴于此种各自为政所带来的不便，美国生物信息界目前已着手一项名为 Bio*的计画，以改善这种混乱情况。该计画包括一系列能自由利用之来源公开的计画，并动员近百名软件工程师，利用 Perl, Java, Python 和 Ruby 等程序语言，开发出能供反复使用的链接库，能够自动处理一般的生物信息工作，例如 DNA 和蛋白质序列的排列组合等。然而 Bio*编码库仍无法解决诸如线上资料来源的脆弱性等问题。要能使各线上数据库能够良好互通的最好方法，便是大家都使用相同方法来表现生物资料，并使用标准的使用者界面；其中较能被接受的可行方法，便是利用网络服务的新科技，能使不同的资料来源提供相同形式的服务，不过这仍有待持续的努力。（金安儿）
出处：Ｎature,419(1872), May 9, 2002, pp.119-120