分子细胞学之父：抛开基因组，建立功能细胞图谱

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    [生物通讯]下一个大型基因组学计划也许根本就不是什么基因组学计划－－如果由Sydney Brenner来制定计划目标的话。

    真菌基因组计划背后75年之久的驱动力正促使科学团体从基因组研究重新退回到一个新使命的焦点：到2020年之前绘制出功能细胞图谱。

    符合其一贯的想象力丰富和语不惊人死不休的作风，享有崇高威望的Brenner在日前于英国Hinxton的Wellcome Trust 基因组园举行的一次生物信息学家会议上对250多名来自世界各地的生物信息学家提出了挑战－－建议“忘记基因组”。

    “对基因组的评注越多，越使其变得隐晦。”他在这次由冷泉港实验室和Wellcome Trust联合主办的基因组信息学会议上做大会发言时告诫所有的与会者。“我们需要将研究的焦点放在细胞上。”

    Brenner置疑了计算方法单独使用揭示基因组序列功能信息的能力－－这是“一个可怕的艰巨任务”，他说道，因为一些问题并非是可解决和可计算的。他认为，未来，生物学家们需要重新退回到实验室操作台上。细胞生物化学的传统“旧式”数据可以用来充实细胞图谱，细胞图谱可作为解毒基因组极其蛋白产物的一个框架图。

    Brenner在发言中提出了通过简化细胞的典型结构减少任务复杂性的建议。由于功能是建立在亚细胞产物相互作用的基础上，因而研究这些产物的整体形式比逐个研究基因产物更为可取，他指出。Brenner认为，第一步应该抓住他所说的“例示问题”－－这是通过精心挑选的无法附上"omics"后缀的词汇，他讽刺说。

    一个例示可能就是某一给定细胞类型中一个基因产物的表达，他举例说。而其它基因表达的产物可能在同一或不同细胞类型中是可变的。因而，细胞图谱计划的目标就是在一系列数据库中评定并描绘出各种细胞类型中所有例示基因的表达。

    之所以预定2020年为细胞图谱计划的完成日期，是根据人类基因组计划从有关想法的提出到最终结出果实所经历的时间来制定的，Brenner补充说。

    细胞图谱数据库必需“准确而且完整”，否则就毫无价值。Brenner批评了当前的生物信息学资源“充满了喧闹声”。虽然没有置疑生物信息学的价值，Brenner表示他不同意那些认为生物信息学能够发现一切的人的想法。

    Brenner被誉为“分子细胞学之父”，1963年他与雅各布一起提出了“复制子”假说，以解释细胞分裂的某些方面。作为最早支持将计算方法用于生物学研究的人之一，Brenner表示这个观点来自于他自己的经验：20世纪60年代中期，他的实验室试图用计算机来重建生物系统。

生物通摘译自GENOMEWEB