[AD340X300]日前,世界各地的许多遗传学家联合起来,抗议Incyte Genomics公司对它的蛋白质
数据库 实施收费的新政策。Incyte
Genomics是位于美国加州Palo Alto的一家私人公司。
这一数据库提供生物学家们研究的重要模式有机物的蛋白质结构和功能信息,在这之前数据库是能够免费进入的。但是Incyte
Genomics最近宣布了它的收费标准:每个实验室每年收费2000美元。公司说这样做是为公共数据库筹集更多的资金。
许多生物学家说,尽管生物学方面的许多数据是研究人员在公共资金资助的实验室里做出来的,但他们还是准备为维持高质量的数据库而付少量费用。但是一些科学家抱怨说Incyte
Genomics的收费太高了。维也纳大学的酶母遗传学家Gustav Ammerer说:“对小实验室来说,这笔费用太高了。”
Incyte Genomics 的数据库收集了包括酵母、线虫、哺乳动物和微生物等模式动物的遗传数据。该数据库1995年由James
Garrels创立,对学术界研究人员免费开放,但对工业界的使用者收费。2000年Garrels将数据库卖给Incyte,他向遗传学家保证说数据库在网上仍是免费向学术界开放的。Incyte没有对收费政策的改变进行解释。
政策的改变给研究人员带来了困难。Peer
Bork是位于爱丁堡的欧洲分子生物实验室的生物信息学家,在Incyte宣布改变政策后不久,他将一篇即将发表的论文的部分数据撤销了,因为Incyte会收录这些数据。他的论文对酵母蛋白质互相作用的不同进行了分析。
数据库收费后其限制条件将更为严格。Bork说:“现在我不知道如何回应来自数据库的调查。”他说他还没有决定是否和其他研究人员分享他的数据。
Bork和其他一些研究人员说,Incyte正在填补一个因公共数据库经费缺乏而出现的空白。Bork认为对数据的解释是需要付费的,“如果一个公司着手填补这个空缺,那么争论点就是价格政策的问题。”
Peter
Okkema是芝加哥依利诺斯大学的生物学家,他认为有关商业数据库的争论是“一个价格的问题而不是根本性的问题”。当他在今年5月得知Incyte即将对其数据库收费时,他给Incyte的董事会写了一封信,有160位科学家在上面签名,要求公司重新考虑它的决定,但他说至今没有收到公司的回复。他认为沉默反映出Incyte的另一个问题:它被指责缺乏与科学界的交流。
BIND是位于加拿大多伦多Samuel Lunenfeld研究所的蛋白质互相作用数据库,BIND的经营者Chris
Hogue说研究人员对数据库的积极输入也不能保持一个数据库的正常运行。他说研究人员常喜欢让别人来整理他们的数据库,“我的建议是研究人员应该自己动手做数据库,如果他们想免费进入,那么就不要假他人之手。”
美国管理模式动物公共数据库的科学家正在积极游说,希望得到国家卫生研究院(NIH)更多的支持。斯坦福大学的Michael
Cherry帮助学校管理Saccharomyces基因组数据库,他说如果有更多的资金支持数据库的扩展,那么那些无法支付Incyte酶母数据库的研究人员将会因之得到补偿。
摘自:科学时报
打赏
下载安捷伦电子书《通过细胞代谢揭示新的药物靶点》探索如何通过代谢分析促进您的药物发现研究
10x Genomics新品Visium HD 开启单细胞分辨率的全转录组空间分析!
欢迎下载Twist《不断变化的CRISPR筛选格局》电子书
单细胞测序入门大讲堂 - 深入了解从第一个单细胞实验设计到数据质控与可视化解析
下载《细胞内蛋白质互作分析方法电子书》