小鼠基因组的物理图谱接近尾声

　　[AD340X300]

    [生物通讯]描述小鼠遗传组成的基因组物理图谱已完成98％，有关数据已在《自然》（Nature）杂志网络版上公布。在人类基因组计划中扮演主力的华盛顿大学圣路易斯医学院基因组测序中心的研究人员，也是这次工作的主力。

    “小鼠在人类生物学和疾病研究中扮演着至为重要的角色。”圣路易斯研究小组的领导人、遗传学副教授John D. McPherson博士说。“这个小鼠基因组物理图谱为我们展示了小鼠基因组的广阔图景，对于医学研究和人类基因组研究将产生极大的帮助。”

    例如，通过比较小鼠和人类的基因组图谱，研究人员可以找到控制基因的DNA区域。识别这些区域对于了解基因在人类健康和疾病中的作用至为关键，但用当前的方法却很难实现。

    小鼠基因组的物理图谱是去年5月公布的小鼠基因组序列草图的一个有益补充。McPherson表示，二者之间的重要差别在于细节和组织形式。

    序列草图是描述字母A、C、G、T代表的组成基因组的化学碱基的图谱，而物理图谱则是组织和描绘这些碱基信息在小鼠20条染色体上的位置和实际距离等详细信息。McPherson将序列草图比作一本百科全书松散的书页，这些书页会提供给我们很多信息，但它们缺乏前后的上下文联系。

    “每一页都提供给我们许多详细信息，如某个国家的人口和气候等。”他说。“但只有当这些书页正确装订成册时，你才会知道这些信息是有关扎伊尔的。”基因组的物理图谱就是将载有DNA序列的“书页”按照正确的顺序装订成册，每一册就是一条染色体。

    不仅如此，用于汇编物理图谱的DNA序列信息与用于汇编序列草图的信息来源不同。由于物理图谱来自于独立的遗传信息渠道，因而研究人员也可用这些信息来进一步检验序列草图。

    “我们比较了这两组来源独立的数据，以确定他们给我们的是否是同样的答案。”

    从另一方面看，这个小鼠基因组物理图谱对于医学研究人员而言也是一大获益。组装这个小鼠基因组物理图谱的DNA片段比组装序列草图所用的DNA片段长。这些长DNA片段已在细菌中克隆。由于物理图谱已经完成，含有这些小鼠基因组片段序列的细菌可以继续保留在细菌中，冷冻保存，并仔细归类。专门研究小鼠基因或DNA片段的研究人员现在可以定位特殊片段在物理图谱上的位置，获得含有感兴趣DNA区域的真正克隆体进行研究，而不必再自己分离这些DNA片段了。

消息来源：华盛顿大学医学院

生物通摘译自BIO.COM