媲美人类基因组计划，国际联盟拟构建大肠杆菌计算机模型

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    [生物通讯]密歇根大学的生物学家Frederick Neidhardt曾于1996年写道：所有的生物学家至少都对两种细胞感兴趣，一种是他们自己正在研究的，另一种就是大肠杆菌 Escherichia coli。半个世纪以来，这种低等的肠道细菌已成为生物学研究不可或缺的工具。现在，它又成为了一项大规模国际建模计划的目标。这个建模计划预计将历时10年，至少耗资1亿美元，有成百上千名来自不同领域的科学家参与其中。

    全世界的科学家都在忙着将大肠杆菌细胞的某些部分计算机模型化，但迄今为止还没有一个完整的、能够涵盖大肠杆菌生活细胞所有功能的计算机模型问世，印第安纳Purdue大学的Barry Wanner说道。本月，一组由Wanner领导的科学家成立了一个国际研究小组来加强全球建立大肠杆菌计算机模型的研究，这项计划称为国际大肠杆菌联盟。

    “如果我们能够解决这个简单细胞的问题，这将是一次重大突破。”Wanner说。Wanner是美国参与这次合作计划的组织：今年3月成立的大肠杆菌模型细胞协会的领导人。计划的其它发起人表示，这个计划使人类基因组计划也相形见绌。“这个计划需要10倍于人类基因组计划的雄心，对于全人类的意义更是超过人类基因组计划百倍。”领导荷兰阿姆斯特丹自由大学的硅细胞建模计划的Hans Westerhoff声称。Hans Westerhoff解释说，人类基因组计划和其相关工作就像是建立一本汽车零部件的完整目录。而大肠杆菌模型则会显示这些零部件是如何组装在一起的。如果计划能够按照预期进行，“所有基因、蛋白以及小分子之间的相互作用都会水落石出。”领导英国葛兰素史克的细胞建模计划的Igor Goryanin说。

    哈佛大学的计算遗传学家George Church认为，有了一个完整的大肠杆菌计算机模型，“你就能够纵览在实验室中可能要花上几百年时间才能搞清楚的变化。”例如，这个计算机模型将使得科学家可以在电脑上创造出各种大肠杆菌突变体，将来自其它生物体的基因导入大肠杆菌，来检查哪一个基因与新抗生素的有效性关系最大。研究的部分经费将来自现已筹集到的资助，但研究人员希望能够吸引更多的新资金：例如，Wanner的研究小组已向美国国家卫生研究院申请了2千万美元的资助。

生物通摘译自SCIENCENOW