又一种链球菌基因组测序完毕

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    [生物通讯]科学家已经绘制出一种引起婴儿和怀孕妇女严重疾病的链球菌的完整DNA序列图谱。

    这种链球菌学名为无乳链球菌（Streptococcus agalactiae），也称B群链球菌（group B strep ，GBS)，是引起婴儿血液感染、肺炎和脑膜炎的主要病原菌。尽管多达40％的健康妇女胃肠道中都寄居着GBS细菌，但GBS感染对于新生儿、怀孕妇女和患有慢性疾病而言的成年人而言却是有生命危险的。幸亏有了B群链球菌高危妇女怀孕期间可以服用的抗生素，自20世纪90年代中期以来，美国患有GBS疾病的新生儿数量已大大减少。

    在美国，约有三分之一的GBS感染与一种称为V型GBS的亚型有关。现在，由马里兰州基因组研究院的Claire M. Fraser博士领导的研究小组绘制出了这种V型链球菌的完整成遗传图谱。研究结果先期发表在美国《国家科学院学报》的网络版上。

    同在基因组研究院从事研究工作的Herve Tettelin博士在一次接受路透社健康专栏采访时，表示，这次V型链球菌基因组测序计划的目的就是缩短研制链球菌疾病疫苗的时间。作为这次发表文章的第一作者的Tettelin表示，通常情况下，从识别出一种疫苗作用靶点到开发出一种新型疫苗所需的时间长达10年甚至更长。

    “我们希望这个图谱能够将疫苗开发周期至少缩减一半。”他说。

    Tettelin介绍说，在传统的疫苗靶点识别和疫苗治疗方法中，科学家们必需逐个鉴别基因，并分别检验这些基因，这是一个漫长的过程。“现在，通过即时绘制出链球菌的完整基因组图谱，我们可以找到每一个有望作为疫苗开发优良靶点的基因。”他说。

    研究人员发现，V型B群链球菌的基因组与其它类型引起人类疾病的链球菌类型－－化脓性链球菌（S. pyogenes）和肺炎链球菌（S. pneumoniae）基本相似。但研究人员也发现，V型链球菌与其它类型链球菌之间存在几个差异，这表明，链球菌为适应其寄居的人类和动物宿主已做出了某些调整和变化。

    当研究人员比较V型链球菌与其它几种已经测序完毕的细菌基因组时，发现有几个基因是GBS链球菌所独有的。他们还识别出几种链球菌所共有的基因，这些基因可以作为疫苗开发的优良目标靶，Tettelin表示。

    测序结果还揭示出100多个重复基因。这些重复基因常常会发生变异，执行新的功能，因此这暗示，V亚型GBS链球菌可能是利用这些重复基因的变异来适应环境的。

    既然V亚型B群链球菌的基因组测序已经完成，“所有的谜题都已在你掌握之中。”Tettelin说。下一步研究人员将开始检验那些被识别为有望成为疫苗作用靶点的基因。

    Chiron 公司为这项研究提供了一定数量的资助。研究小组中有几名成员来自Chiron 在意大利的疫苗开发基地。

消息来源：Proceedings of the National Academy of Sciences 2002;10.1073/pnas.182380799

生物通摘译自REUTERSHEALTH