开发牛基因组的计划正加紧进行

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    [生物通讯]美国一家生命科学公司正联合农业综合企业的研发力量，利用牛基因组一组新的前期测序数据开展一项旨在识别多个牛重要遗传性状标记的计划。

    总部设在马里兰州萨维奇的MetaMorphix公司，已获得1x覆盖率的前期奶牛基因组数据，以及涵盖600,000个单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs)的图谱。MetaMorphix公司今年3月份购买赛莱拉基因组公司的动物基因组学和基因型分析业务时，赛莱拉保留了对MetaMorphix公司大部分业务的兴趣。

    MetaMorphix的基因组学子公司－－设在加州戴维斯市的MMI 基因组学公司正与国际农业公司Cargill下属的两个子公司合作，利用牛SNPs的前期图谱，绘制能够覆盖整个奶牛基因组的物理图谱，并定位与奶牛性状连锁的遗传标记。

    “我们采用的方法与国际上公立资助的牛基因组计划所用的方法不同。”MMI 基因组学公司（前赛莱拉子公司AgGen）的研发部主管Sue Denise说。“我们计划在未来两年里，利用这个原始的奶牛基因组序列图自己筛查SNPs，识别出重要的遗传标记。”

    虽然MetaMorphix 的牛基因组数据是私人拥有的，但公立的国际研究小组也正在加紧测序和分析牛基因组。美国国家人类基因组研究院（National Human Genome Research Institute ，NHGRI)正考虑测序奶牛基因组的议案，但计划必需证明其价值高于其它有竞争力的大型哺乳动物，如够、猫和猪等。

    另外，一个由来自美国、法国和加拿大的科学家组成的公立资助的国际研究小组已于今年春季开始了一项250万美元的研究计划来创制已测序完毕的BAC(细菌人工染色体）图谱。该计划的目标是为快速有效测序牛基因组提供舞台。

    该计划由美国农业部设在内华达州Clay中心的农业研究局的Steve Kappes ，以及伊利诺斯大学W.M. Keck比较与功能基因组学中心的主任、动物科学教授Harris Lewin共同领导。

    该计划的第一阶段，将由加拿大研究人员对含有280,000 个克隆的BAC文库进行遗传“指纹分析”。该文库是由加州的一个实验室创制的。接下来，Lewin领导的伊利诺斯研究小组与其在马里兰州NHGRI的合作者将测序至少100,000个经过指纹分析的BAC克隆。测序结果将与BAC指纹分析的结果结合起来，组成一个测序完毕的图谱。

    同时，一组由伊利诺斯Keck 中心的功能基因组学分部主任Mark Band领导的研究小组正在检查重要牛基因的功能，并绘制牛与人类的比较基因组图谱。“计划的主要目的就是找到牛表型性状的遗传基础。”Band说，他指出牛基因组与人类基因组的大小类似（约有3百万个碱基对）。

    MetaMorphix公司的有关人士预言，奶牛基因组测序的完成将会导致诊断和治疗新技术的产生，这些新技术也可用于与家畜饲养和家畜卫生有关的工业生产。

    援引etaMorphix的首席执行官间总裁Ed Quattlebaum的话：“现在我们正在积极开发奶牛基因组及其图谱的商业用途和技术，以期促进家畜生产和卫生行业，最终造福人类。

生物通摘译自GNN