塞莱拉公布小鼠染色体的分析结果

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BW HealthWire 2002年5月30日消息，塞莱拉（Celera Genomics）今天宣布发表了小鼠16号染色体和人类基因组的比较分析，研究是基于Celera Genomics公司的小鼠和人类基因组图谱进行的。另外Celera Genomics还宣布了小鼠染色体的DNA序列序列已经存入GenBank，日本DNA数据库和欧洲分子生物实验数据序列库。

这个几乎完整的染色体序列被决定作为整个基因组测序和小鼠基因组图谱的一个部分，这个策略已经成功的应用于果蝇和人类基因组。小鼠基因组16号染色体被从Celera群体中挑选出来分析，主要是因为它与人类21号染色体的很大一段区域具有同源性。另外一方面它与其他5条染色体具有‘同线形’区域。染色体的同线形描述区域就是说它们有相似的基因和DNA序列，因为它们是从一个共同的原始祖先进化而来的。

“实验室的小鼠是用价值无法衡量的模型帮助研究人员探索人类生物学性质和健康保健问题，”基因组计划的副总裁Mark D. Adams博士说。“我们认为这篇文章的发表说明了比较基因组学是一个很有力的工具，获得将来新的治疗疾病方法的信息。”

这些信息将以论文形式发表在5月31日的《科学》（Science）杂志上，作者是科学部门和分析部门的负责人Richard J. Mural博士、Mark D. Adams和咨讯研究的副总裁Eugene Myers博士。这篇文章的一些关键要点如下：

●               Celera鉴定了小鼠16号染色体上的731个蛋白编码基因。Celera发现大约98%的小鼠基因与人类基因具有同源性；小鼠的这条染色体上只有14个基因与人类无同源性。

●               小鼠16号染色体上大部分区域是十分保守的，认为是大约100百万年的进化过程导致了人类与小鼠的这些差异。人类基因组的7个区域与小鼠16号染色体具有保守的同线性关系，也就是说它们已经储备了一定的基因含量和次序。

●               小鼠基因组比人类基因组大约小10%，因为其重复DNA含量较低。

 

研究人员可以访问www.celera.com以获得使用小鼠16号染色体序列、转录子和有关蛋白质谱，这篇文章题目为：“Celera’s mouse assembly: Improving the understanding of human diseases through human-mouse comparisons”。

全基因组随机测序

Celera Genomics在2001年3月完成了小鼠基因组的第一个序列及其组合，利用全基因组鸟枪技术(WGS) Celera获得了一组专利数据。作为这项计划的一部分，从大约27.4百万个序列读码框中产生了162亿个DNA碱基对，是这个基因组的5.3倍。对来自于4种系别(A/J, DBA/2J, 129X1/SvJ, and 129S1/SvlmJ)的DNA序列进行了集合组装。WGS技术于1995年在基因组研究院(TIGR)第一次被使用作为译码器分析了一种非共生生物的完全基因组。

WGS技术就是随机将小鼠染色体剪切成数百万个2000、10000和50000bp长度的片段。这些染色体片段被插入质粒载体，然后在E. coli中进行增殖复制产生数百万个同样的片段。Celera测序方法的一个主要特征是每个DNA片段的两个末端也被同时测序（双点测序）。

关于Celera小鼠基因组的组装

Celera组装和注解小鼠基因组，并且很快公布了小鼠参考的SNP数据库包括3.0百万个简短的图谱变化，读者可以通过Celera Discovery System(TM) (CDS)使用相关资料。Celera Discovery System(TM)是一种集成的网络基础的技术平台，使用户能够体会Celera的计算工具，超级计算机的功率，以及获得基因组和生物学相关数据从而加快全世界研究人员的开发过程。Applied Biosystems Group通过它的新的知识产业不久将成为CDS的专利销售者，这将使CDS和其他基因组及生物学信息融为一体。

（zhh译，Christ校——基因潮编译,未经同意不得转载）