可免费查阅的小鼠基因组信息诞生

　　

新生命网站编译 虽然没有军乐队，也没有举行白宫招待会，但是研究人员仍然庆祝一个重要的哺乳动物基因组的公布，这个动物是一只被称为“黑色6号”的实验室小鼠。小鼠基因组序列联合会宣布他们已经完成了C57BL/6J小鼠的基因组草图，该草图占小鼠基因组全序列的96％，并且研究人员可以通过互联网免费查阅该信息。


在去年，位于马里兰Rockville的塞瑞拉基因组公司就宣布他们已经完成了小鼠基因组序列的草图，但却对数据的使用实行收费（《科学此刻》，2001年4月27日）。这一次公开的数据由两个小组联合承担完成，这两个小组是麻省剑桥怀特黑德基因组研究中心以及Hinxton桑格尔中心。两个小组使用的方法都是“全基因组鸟枪克隆法”，这与塞瑞拉公司用来测定小鼠基因组和人类基因组的方法一样。该方法涉及将基因组切成许多重叠的片段，再对这些片段分别测序，然后在超级计算机的帮助下将它们按顺序拼接起来。

美国国家人类基因组研究所的负责人Francis Collins说：“此基因组草图展现出了令人惊讶的高质量，超出了任何人的期望。”他将此归因于高质量的原始数据、精密的拼接方式，以及研究人员使用的是纯系小鼠，从而减小了可变性。小鼠基因组联合会表示他们已经鉴定出了22500个小鼠基因，少于人类的34000个，该数据具有很高的可信度。Collins指出，差异的产生主要是由于对基因的定义不同。他认为人类和小鼠最终确定的基因数量将在30000到40000个之间。怀特黑德研究所德分子遗传学家Eric Land预计至少还需要3年才能将草图上的间隙填完，彻底完成小鼠基因组序列。

费城宾夕法尼亚大学的分子生物学家Maja Bucan表示：比起塞瑞拉公司的数据来，这份新的草图看起来更为优秀。虽然她也是塞瑞拉数据库的使用者，但是她评价由欧洲分子生物学实验室提供的此新数据的注释版，更便于用户使用。国家癌症研究所的遗传学家Neal Copeland以前也一直是塞瑞拉数据库的使用者，但是他认为现在联合会已经赶了上来，塞瑞拉公司已经失去了优势。

摘自 新生命