人类基因组知识库:下一个人类生物学网络中心

【字体: 时间:2002年05月14日 来源:

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    [生物通讯]一个国际研究小组创建了一个新数据互联网中心,该中心旨在将两个全异的科学“中流砥柱”--全自动基因组学注释数据库和假设驱动研究(hypothesis-driven research)联系到一起。

    这个信息管道--人类基因组知识库(Human Genome Knowledgebase),旨在通过构建一个整合描述人类生物学过程和通路数据的每一比特、每一字节的站点来填平两大数据库之间的鸿沟。但现在知识库尚处于起飞阶段,只包含DNA复制方面的数据。

    根据冷泉港实验室基因组和生物信息学部的一名研究人员Elizabeth Nickerson,该知识库网站将是一个复杂的综合性网站,涉及人类生物学的每一方面。该知识库完一旦成,将成为联系全世界研究人员共同挖掘从基因组学到蛋白组学数据库、文献综述以及Gene Ontology(GO)数据库宝藏的媒介。

    “我们最终想要为需要人体器官生物学过程信息的研究人员建立一个综合全面的资源库,”Nickerson在2002冷泉港基因组测序与生物学会议上宣布。“我们希望当你们发出“我不懂这个课题”,“究竟该如何才能了解这些难题”的抱怨时,这个知识库能会成为你们个可靠的资源。”

    例如,全部通路都以正文形式进行描述,旁附简短的陈述性文字来帮助读者更好地理解某一特殊生物学过程的关键部分。该知识库将对科学研究起到重要的推动作用;当前的生物学资源库有在线教科书等,但它们没有把科学家同原始文章或基因组数据库联系起来。Nickerson补充说。

    该研究由美国国家卫生院资助,Lawrence Berkeley实验室和Wellcome Trust的研究人员进行。

生物通摘译自GENOMEWEB

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