Sanger中心宣布斑马鱼基因组图谱将于2005年完成

　　

    [生物通讯]Sanger中心近日透露，绘制斑马鱼基因组图谱的计划有望于2005年中期完成，有关数据将向公众免费开放。

    Sanger的研究人员Sean Humphray向GENOMEWEB的记者透露，来自Hubrecht实验室、Max-Planck研究院和Sanger中心的研究人员正在通过应用生物系统公司（ABS)的3700测序仪系列对序列进行分析。Sanger中心负责数据协调、图谱汇编以及具体的操作工作。

    研究小组当前正在利用限制性内切酶指纹分析法绘制细菌克隆图谱。该图谱基本由两个文库——CHORI-211和the DanioKey组成。

    这些数据最终将为全长基因组的测序铺平道路，Sanger中心将综合利用全长基因组鸟枪法（WGSG，whole genome shot gun，WGSG）和一种称为Clone-by-clone的方法，这是一种稳步、保守和依赖于协调的方法，以BAC（细菌人工染色体）克隆构成的物理图为基础，然后选择由最少量克隆组成的重叠图，最后对这些克隆分别测序，组装成全基因组序列。

    现在，两个文库的测序工作都已接近尾声，Humphray在近日召开的冷泉港2002基因组测序于生物学会议的发言中说。而Max-Planck研究院与波士顿儿童医院将承担精炼数据的RH作图工作，他补充说。

据Humphray透露，目前为止，研究小组已组将102,000个指纹装配到9,245个序列重叠群中。

摘译自GENOMEWEB