用小鼠全长基因组BAC芯片筛查肿瘤

　　

    [生物通讯]根据一项最新研究，研究人员首次利用小鼠全长基因组BAC芯片来寻找肿瘤之间的遗传联系。

    与其它常规的微卫星方法相比，小鼠960BAC芯片能够检测到杂合性的丢失，研究人员发现“BACs非常适合检测肿瘤中基因绝对拷贝数的变化。”文章的主要作者、加州大学圣地亚哥分校癌症中心的遗传学教授Allan Balmain说道。

    “它使我们能够检测出基因拷贝数或缺失数的绝对变化。”他补充说。“我们需要一个全长基因组的方法来快速缩小重要领域的研究范围。”

    这项研究发表在4月期的《自然生物技术》杂志上，Balmain表示，这是首次有关利用全长基因组小鼠BAC芯片的报道。该研究的合作者还包括休斯顿贝勒医学院和英国Wellcome Trust Sanger研究院的科学家们。研究人员应用的是由休斯顿Spectral Genomics公司生产的玻璃芯片。

    虽然科学家使用BAC方法能够高度精确地检测出基因拷贝数的绝对变化，但微卫星分析常常能提供有关等位基因缺失和失衡等更好的定性指示，作者在文章中写道。因而，研究小组推荐组合使用这两种方法来检测肿瘤的遗传联系。

    BAC研究是将1000个BACs排列在一个芯片上，，它在几小时内就能完成杂交，而常规的微卫星分析方法却需要几周的时间。因而，BAC研究的快速使得它更适用于药物和诊断方法的开发，Balmain认为。

    “该技术最主要的用途在于肿瘤筛查，”他说。“你可以将BAC芯片的特征作为一个确认肿瘤恶性程度的诊断工具来利用。”

    其次还可以用于药物开发。“高分辨率BAC芯片使我们能够找到肿瘤基因。一旦你发现特异基因，它们就成为药物开发的良好目标靶。”Balmain说道。

    Balmain还表示，未来两到三年内，单一芯片上的BACs数量将会提高到30,000个。

生物通摘译自GENOMEWEB