比较基因组学：UCSC基因组数据库新增小鼠基因组数据

　　

    [生物通迅]加州大学圣克鲁斯分校(UCSC)的研究人员又将一个小鼠基因组的汇编数据添加到他们深受欢迎的汇集人类基因组数据的网络浏览器中。

    “95％的人类基因都能在小鼠中找到直向同源基因。”加州大学圣克鲁斯分校该计划主任David Haussler说。“因此几乎你感兴趣的每一个基因都能在其它物种中找到对应的基因。”

    小鼠基因组浏览器项目具体由加州大学圣克鲁斯分校的科学家Jim Kent领导，于上周注册完毕，本周全线开通。

    “对于医药公司而言，小鼠基因组浏览器在某种意义上比人类基因组还重要，这是因为小鼠才是可以真正可用的实验材料。”Haussler在最近的一次访谈中告诉GENOMEWEB记者。“同时拥有小鼠和人类基因组数据库能够加速我们对这些资源的利用，因为通过基因组比较，我们能够了解的实际情况将要多得多。”

    研究人员已经发现，早先用于比较不同物种基因序列的模型实际并未击中目标。

    “既然我们能够比较小鼠与人类的总基因组，那么我们也就是正处在在大量数据组中寻找分子进化模式的过程中。”Haussler说。例如，研究人员可能会问过去用于比较序列的分子进化模型现在是否还适用。

    Haussler认为，答案是否定的。“我的答案是那些模型太不成熟了。它们没有把前后联系的影响考虑进去，而这个因素对最终结果有很大的影响。”

    “从科学的角度来看，比较基因组学比人们预想的要难得多。”他认为。“这是非常具有挑战性的工作，因为你是在寻找物种之间的保守模式和变异模式。我们通过比较的方法在生物学领域获益颇丰，但在基因组水平上，比较就不那么得心应手了。”

    “因此，如果你没有很强大的统计模型，比较基因组学就无异于大海捞针。”就开发更为复杂精细的生物信息学软件和统计模型这一点而言，生物信息学中蕴藏着绝大的机会，这才是比较基因组学真正的前途所在。

生物通摘译自GENOMEWB