TIGR全面进攻炭疽杆菌基因组

　　

    [生物通讯]直到最近微生物学家们最钟爱的菌类被测序完毕，他们才开始露出笑脸。现在基因组研究最新的“金本位’标准是能够比较一个物种多种不同的基因组。美国马里兰州基因组研究院（Institute for Genomic Research ，TIGR)正致力于使炭疽杆菌达到如此水平。TIGR计划测序来自全世界多达20个炭疽杆菌株系的基因组，这比其它任何已经测序完毕的物种还要多2倍。

    拥有多种炭疽杆菌基因组信息能够帮助研究人员查出潜在的生物恐怖主义分子，并有助于设计抵抗炭疽杆菌的药物和疫苗；而比较这些不同株系的基因组还将揭示为什么某些株系比其它株系毒性更大，或为什么一些株系更易在土壤中生存，路易斯安娜州立大学的炭疽研究人员Martin Hugh-Jones表示。查明多种株系的遗传多样性本身也是一件令人兴奋不已的事情，TIGR主任Claire Fraser补充说。”这是我们很久以前就想做的事情，事实上它与生物防御没有任何关系。”这些株系将由来自北亚利桑那州立大学的炭疽遗传学家Paul Keim挑选， Keim参与了去年秋季炭疽邮件案件的调查工作(Science, 30 November 2001, p.1810)。Keim已经列出了一张候选株系的一览表，他认为这些株系完全代表了炭疽杆菌的多样性。最先的4个株系测序完成后，TIGR和该计划的资助者－－美国国家过敏与传染性疾病研究院将对该研究计划进行回顾总结以证实这些信息是多么有用。按照当前每基因组15万美元的经费计算，该计划的花费将达到300万美元。

    TIGR已经完成了两个炭疽杆菌株系基因组的测序工作。一个是称为Ames的实验室培养株系，对其的测序已进行多年，最后一个藩篱将在几周内跨越，这是TIGR的Timothy Read上周在第二届微生物基因组会议上公布的。该研究院还确定了现在已知为佛罗里达株系的炭疽杆菌基因组序列草图，就是这个株系去年10月使一名图片编辑丧命。尽管这个株系同样也属于Ames，但TIGR表示，一些微小的差异使其与Ames区分开来，这些差异也许会有助于识别出恐怖袭击的作恶者。

生物通摘译自SCIENCE NOW