基因芯片制造的新动力

【字体: 时间:2002年11月13日 来源:

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慕尼黑——那些需要制作自己的DNA芯片,而不是依赖昂贵的商业芯片的生物学家现在能够更好地DIY工作了,这要归功于位于柏林的德国基因组资源中心(RZPD)制造的一组人类DNA克隆。

芯片已经日益广泛地被从事基因表达研究的科学家所使用,因为芯片能够帮助他们比较癌症组织和非癌症组织中数千个基因的活性。大多数商业芯片系统要包括数千个被称为寡核苷酸的人造核苷酸短序列,这些序列能够与由活性基因转录而来的特殊信使RNA(mRNA)连接。

但许多研究人员选择利用逆转录酶,和直接来自mRNA的互补DNA(cDNA)来自己制造比较价廉的芯片。一旦研究人员获得了一个DNA库,他们就能制造cDNA拷贝从而创造出许多芯片。

非盈利性组织——德国基因组资源中心表示,其人类cDNA组的质量要比其他实验室高,而且经过排列。RZPD的一个客户说,他们利用该中心cDNA克隆制造的芯片要比商业核苷酸芯片便宜很多。

RZPD的克隆具有许多优势。每个克隆经过反复测序和校验。而在大多数实验室中大约有10%-20%样本的标注不正确。RZPD还确保每个cDNA都代表了一个独特的基因,而大多数cDNA实验室往往包含特殊活性基因mRNA的多个拷贝。

Brigham的基因芯片中心的主任Steven Gullans说:“一个序列经验证、非随机cDNA库对依靠高质量试剂进行生物学研究的人员来说简直是一个奇迹。”

RZPD的克隆组包含32000个基因,另外10000个将在未来几个月中陆续加入——使其比其他基因库拥有更多的基因。Göttingen大学的生物化学家Jobst Landgrebe说:“将40000个左右的cDNA点上芯片就意味着我们能覆盖绝大多数人类基因组。”他补充说从这个cDNA组制造芯片的价格不超过75欧元。

摘自 中华基因网

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