研究人员构建出酵母基因组与蛋白组的互作图谱

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    [生物通讯]Whitehead研究院的研究人员构建了酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）基因与蛋白质相互作用的基因组图谱，从而描绘出真核生物复杂交错的基因调控网络。

    这项研究发表在10月25日期的《科学》杂志上，是了解生活细胞中基因表达调控研究的一次重大进展。

    由麻省理工学院的David Gifford 和Whitehead研究院的Tong Ihn Lee 和Richard Young领导的研究小组采用一种叫做定位分析（location analysis）的技术查明了141个酵母转录因子中每一个是如何与基因启动序列结合的。

    通过DNA芯片技术，研究小组将这些转录因子中的106个做了标记，发现将近4,000 个调控因子、启动子互作一共与6,270 个酵母基因中的2,343个有关联。有趣的是，他们发现在某些情况下，酵母基因组中的一个启动区可以被许多转录调控因子结合，而早先认为这一现象只限于在更高等的真核细胞中发生。

    对这些信息进行编辑整理后，Young的研究小组构建出细胞内一个交错连接的复杂基因调控网络。“大多数细胞过程－－如果不是所有过程－－的控制都以形成调控其它转录因子的转录因子网络为特点。”研究人员在论文中写道。

    在论文中，研究小组提出了6个不同的转录因子、启动子互作的网络模型“基本模式”，在许多情况下，这些互模型在同一功能范畴中精心刻画了启动子与调控因子之间的反馈循环。接下来研究人员将这些模型组装到一个框架中来预测酵母细胞周期的整个调控过程和基因表达模式。

当前，研究小组正采用同样的技术来研究人类细胞中已知的1,7000个转录因子。

生物通编译自GENOMEWEB