新技术推动蛋白质组学研究大步前进

　　

生物通编译：在这个生物学高速发展的时代，蛋白质的研究可能显得令人恼火的缓慢：它们复杂的化学性质和精密的三维形状令它们很难进行分析。但是一项突破可能大大加速对它们的研究。在今天Science网上发表的一篇论文中，研究者报告说他们制造了一种蛋白芯片可以同时分析5800个酵母蛋白质。这种芯片通过揭示与数千个蛋白质相互作用的“伙伴分子”而有助于科学研究以及临床诊断工作。

一个镍包被的显微镜玻片上点有代表5800个独特蛋白质的6566个蛋白质样品。

这种新的蛋白质芯片与在邮票大小的表面点有可以同时追踪一个组织样品中数千个基因活性的核酸序列的DAN芯片类似。尽管DNA芯片技术已经商业化，并且现在广泛应用于科研中，多年来科学家们一直建议制造类似的芯片来分析全蛋白质组（一个组织或甚至一个生物体中所有的蛋白质集合）。但是到目前为止的大多数芯片只能够分析少量不同蛋白质。

现在耶鲁大学生化学家Michael Snyder与在耶鲁和北卡州立的合作者们打破了这一纪录。他们首先克隆了5800个酵母基因，将这些基因插入其它酵母的细胞中，诱导这些细胞过量表达这些蛋白质，然后收集纯化。之后他们使用一个目前标准的DNA阵列机器人在一个显微镜玻片表面进行了这些酵母蛋白质点样。为了找到酵母蛋白质结合的靶分子，他们在该玻片上喷洒上被检蛋白溶液。然后增加一个荧光标签突出了被检蛋白质结合的点。

Snyder和合作者们利用数个版本的该技术，可以迅速鉴定到与数千个排列的酵母蛋白质相互作用的蛋白质。通过这一方法他们新发现了33个结合钙调蛋白的蛋白质，52个结合磷脂酰肌醇肽的蛋白质。钙调蛋白是参与钙信号传到的广泛分布的一种蛋白质，磷脂酰肌醇肽是一种细胞膜蛋白，参与生长，分化和细胞骨架重排。

纽约洛克菲勒医学院的生化学家Eric Phizicky说：“能够在整个蛋白质组的基础上研究任意蛋白的活性是生化学家们的梦想。”（版权所有 转载请注明）

——摘译自7月26日Science now（heartlake）