使用基因芯片来诊断癌症

【字体: 时间:2001年06月06日 来源:

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生物通编译:为了选择正在蔓延的癌症的最佳治疗手段,医生们需要知道癌细胞开始蔓延的组织。现在,研究者们已经设计出计算机程序来区分四种看起来类似的,致死的肿瘤在遗传上的细微差异。这个方法可以带来各种癌症更快的诊断和更合适的治疗方法。

微阵列将在癌症的诊断中发挥越来越重要的作用

病理学家们经常通过研究显微镜下细胞的大小,形状和颜色来确定癌症的起源。对于那些看起来相似的癌细胞,如统称为小圆蓝色细胞瘤的四种罕见儿童肿瘤而言,这一鉴定工作相当困难。在这样的情况下,病理学家们只能依赖于几种与诊断性蛋白质结合的染料做出判断,但是这可能会延误诊断。美国国家人类基因组研究所(NHGRI)的分子生物学家Paul Meltzer和儿童癌症学家Javed Kan,认为DNA指纹可能是更快和更精确的手段,他们和同事们一起研究了四种癌症(成神经细胞瘤,横纹肌肉瘤,非Hodgkin淋巴瘤和Ewing瘤)中的基因活性。

这个研究组使用DNA微阵列的方法同时观察了6567个基因。在这些基因芯片上,每个基因的活性通过染色深浅来显示。为了确定基因的表达形式,研究者们然后通过一种称为人工神经网络的程序运行了这些颜色深浅数据。这个程序模拟了大脑中神经元的行为,可以通过试验和错误进行自我学习。Meltzer说:“这样就可以获得癌症中发生的完整信息了。”

研究者在今年6月的Nature Medicine上报告说,这个程序在学习了每种癌症的特点之后,正确地鉴定了所有20个试验样品。还象排除健康细胞一样,正确地排除了五个其它类型癌症的样品。

西雅图Fred Hutchinson癌症研究中心的细胞生物学家Lee Hartwell说:“我认为这是相当令人鼓舞的。”他说,尽管样本数不大,但是这项工作清楚地显示出尽管个人之间存在着遗传差异,但是那些来自相同细胞和组织类型的癌症之间的相似性还是足以与其它癌症区分开来。“这种微阵列将在诊断中发挥越类越重要的作用。”(版权所有 转载请注明)

——摘译自6月4日Science now(heartlake)

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