美公布果蝇基因图谱近半有错遭猛烈抨击

【字体: 时间:2001年05月31日 来源:

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人类基因图谱草图会包含有错误吗?

5月17日出版的《自然》杂志发表了一个惊人的消息:美国塞莱拉公司公布的果蝇基因图谱存在“大量而严重的缺陷”。此消息传出,去年因破译人类基因密码而轰动世界的塞莱拉公司及其所取得的“辉煌成就”,立刻受到世人质疑。

果蝇基因图谱近半有错误

《自然》杂志发表的最新报告是由美国斯坦福大学生物信息学家萨谬尔·卡林和他的同事做出的。卡林称,他在使用塞莱拉公司的果蝇基因图谱时发现了许多错误,“这使我极为愤怒”。愤怒之余,他和几位同事合作,对塞莱拉公司已经公布的果蝇基因图谱进行了认真的核查,发现其中29%“完全正确”,26%基本正确,而剩下的45%不是存在“轻微缺陷”,就是有“严重错误”。如此结论对塞莱拉公司来说无疑是当头棒喝。

塞莱拉公司是美国马里兰州的一家私营公司,2000年3月它公布了果蝇因图谱,6月又与共有6国参加的人类基因图谱计划组一起,公布人类基因图谱草图。这一成果被称为2000年世界科技界的最重大成果,如今却受到斯坦福大学科学家的质疑,有国际媒体进而提出一个十分敏感的问题:如果果蝇基因图谱存在错误,那么塞莱拉公司公布的人类基因图谱怎么样呢?人类基因图谱计划组的成果又怎么样呢?

50%正确率,荣耀还是耻辱?

塞莱拉公司在研究基因图谱方面曾经采用了一种被称为“快枪”的研究方法,在短短两年之内就取得了震惊世界的研究成果。美国政府方面的研究人员以前就对这种研究方法的准确性提出过疑问,这一回更是让卡林触到了痛处。卡林不客气地说:“我认为果蝇基因图谱的公布太急于求成了……对人类基因图谱我不想发表什么看法,但我提一个警告,任何人如果要引用目前的基因图谱结果,都要千万小心。”

面对如此说法,塞莱拉公司先是保持沉默,但在新闻媒体的追逼之下,公司发言人不得不出来招架。公司女发言人希思·科瓦尔斯基说:“我们从未说过果蝇基因图谱已经100%完成,基因图谱的解释和各种分析也许还需进行几十年。”

当然也有人站出来为塞莱拉公司说话。加州大学伯克利分校基因学家杰拉尔德·鲁宾说:“我认为50%的正确率应该得到褒奖,而不是批评。”同时他指出,卡林研究的是存放在瑞士基因数据库中的数据,而不是塞莱拉公司本身的研究结果。其实,鲁宾也是在为自己辩护,他曾经与塞莱拉公司的总裁克雷格·文特尔合作,共同发表了有关果蝇基因图谱的成果。

克雷格·文特尔最后也沉不住气,站出来说话了。他表示,促进科学进步有两种方法:一种是做一些大事,另一种对做大事的人进行批评。我们选择了前者,而我们的一些批评者却选择了后者。言下之意,卡林的批评不值得大惊小怪。

塞莱拉公司很受伤

最近以来,塞莱拉公司不大顺心。去年,塞莱拉公司因在基因图谱研究方面取得突破性进展,不仅给公司带来了极大声誉,而且让公司进账颇丰,公司股票曾经一涨再涨。但随着美国科技股的剧烈下跌,塞莱拉公司也受到强烈冲击,公司股价缩水不少。今年4月底,塞莱拉公司新财年第三季度业绩报告称,公司季度亏损2910万美元,大大超过了上一年度同期的2410万美元。受这一业绩报告影响,公司在纽约证券交易所的股价又下跌了1.2%。不过,该公司新财年第三季度总收入却从上一年度同期的1110万美元增长到2340万美元。收入增长主要是公司基因数据库的贡献,许许多多的生物技术公司和研究实验室订购使用该公司的基因数据。

斯坦福大学科学家的新发现对塞莱拉公司实在是个不小的打击。不过,是否真是这么回事,还有待更多的科学家加以证实。据报道,卡林的研究成果受到过美国《科学》杂志的冷遇。他最早将论文发给《科学》杂志,但该杂志迟迟不愿发表。卡林抱怨道:“他们将我的论文拖了5个月。”随后卡林的论文才在《自然》杂志上发表。现在最关键的是要有更多的科学证据,来证明塞莱拉公司的成果是对还是错。假如将来有更多的人提出疑问,塞莱拉公司的前途真要大为不妙了。

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