小鼠基因组项目正在进行当中

【字体: 时间:2001年05月11日 来源:

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生物通编译:旧金山消息 - 公共基因组测序机构说他们已经建立了几乎整个小鼠基因组的初步序列数据,从而达到了自己在去年十月设定的目的。

但是他们还没有确定如何达到满意的精确度而结束这一计划,这可能意味着对基因组中的每个碱基平均进行十次以上的测序。

小鼠测序联盟(Mouse Sequencing Consortium)一直在使用由私有公司——塞莱拉基因组公司创立的高通量的“鸟枪法”测序方法。这一技术包括对小鼠基因组中长为500到700碱基的大约600万个片断进行测序,然后进行组装。

公共测序联盟称现在已经对基因组中94%的部分进行了序列测定,平均每个碱基测序三次。但是序列数据仍然还没有进行拼接组装。公共数据库中仍然存在1500万以上的无序片断。

该联盟是在塞莱莱公司宣称完成小鼠基因组的26亿碱基的测序和拼装后十天做此声明的(见Nature 411, 8; 2001)。与塞莱拉公司不同的是,所有研究者将可以免费获得该公共数据。

但是该计划的下一步仍然没有确定。国家人类基因组研究所(NHGRI)的项目官员Jane Peterson说,这是一贯的计划,因为部分序列数据将用来确定用来完成整个基因组使用的技术。(版权所有 转载请注明)

——摘译自5月10日(heartlake)

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